物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2010年
7期
1988-1997
,共10页
蛋白质相互作用%界面性质%界面结构特征%结合自由能计算%蛋白质相互作用设计%蛋白质结合/解离
蛋白質相互作用%界麵性質%界麵結構特徵%結閤自由能計算%蛋白質相互作用設計%蛋白質結閤/解離
단백질상호작용%계면성질%계면결구특정%결합자유능계산%단백질상호작용설계%단백질결합/해리
蛋白质相互作用在生命活动中起着重要作用.研究蛋白质间相互作用的本质有助于了解生命活动中这些基本单元的作用.本文主要综述了近期蛋白质相互作用研究的进展,包括蛋白质相互作用界面的基本性质,蛋白质结合自由能的计算方法,不同相互作用在蛋白质结合/解离中的角色和差异,以及上述知识在蛋白质相互作用设计中的应用.蛋白质相互作用界面的特性,例如界面大小、保守性以及结构的动态性质,使得具有生物功能的蛋白质相可作用界面区别于非特异性的晶体堆积界面.生物功能界面的一个重要结构特征是界面上存在着关键残基以及相对独立的相互作用模块.利用多种方法,如MM-PBSA、统计平均势以及不同的相互作用自由能模型,可以在不同的精度上计算蛋白质相互作用自由能.利用蛋白质相互作用界面的特点,从不同的角度进行蛋白质相互作用对的设计与改造,近年来已经有了不少成功的例子,但还存在着很大的挑战.我们认为在今后的蛋白质相互作用设计中,考虑各种因素对蛋白质结合与解离的动力学过程的影响将有助于提高人类控制蛋白质相互作用的能力.
蛋白質相互作用在生命活動中起著重要作用.研究蛋白質間相互作用的本質有助于瞭解生命活動中這些基本單元的作用.本文主要綜述瞭近期蛋白質相互作用研究的進展,包括蛋白質相互作用界麵的基本性質,蛋白質結閤自由能的計算方法,不同相互作用在蛋白質結閤/解離中的角色和差異,以及上述知識在蛋白質相互作用設計中的應用.蛋白質相互作用界麵的特性,例如界麵大小、保守性以及結構的動態性質,使得具有生物功能的蛋白質相可作用界麵區彆于非特異性的晶體堆積界麵.生物功能界麵的一箇重要結構特徵是界麵上存在著關鍵殘基以及相對獨立的相互作用模塊.利用多種方法,如MM-PBSA、統計平均勢以及不同的相互作用自由能模型,可以在不同的精度上計算蛋白質相互作用自由能.利用蛋白質相互作用界麵的特點,從不同的角度進行蛋白質相互作用對的設計與改造,近年來已經有瞭不少成功的例子,但還存在著很大的挑戰.我們認為在今後的蛋白質相互作用設計中,攷慮各種因素對蛋白質結閤與解離的動力學過程的影響將有助于提高人類控製蛋白質相互作用的能力.
단백질상호작용재생명활동중기착중요작용.연구단백질간상호작용적본질유조우료해생명활동중저사기본단원적작용.본문주요종술료근기단백질상호작용연구적진전,포괄단백질상호작용계면적기본성질,단백질결합자유능적계산방법,불동상호작용재단백질결합/해리중적각색화차이,이급상술지식재단백질상호작용설계중적응용.단백질상호작용계면적특성,례여계면대소、보수성이급결구적동태성질,사득구유생물공능적단백질상가작용계면구별우비특이성적정체퇴적계면.생물공능계면적일개중요결구특정시계면상존재착관건잔기이급상대독립적상호작용모괴.이용다충방법,여MM-PBSA、통계평균세이급불동적상호작용자유능모형,가이재불동적정도상계산단백질상호작용자유능.이용단백질상호작용계면적특점,종불동적각도진행단백질상호작용대적설계여개조,근년래이경유료불소성공적례자,단환존재착흔대적도전.아문인위재금후적단백질상호작용설계중,고필각충인소대단백질결합여해리적동역학과정적영향장유조우제고인류공제단백질상호작용적능력.
