海洋湖沼通报
海洋湖沼通報
해양호소통보
TRANSACTIONS OF OCEANOLOGY AND LIMNOLOGY
2011年
1期
94-100
,共7页
郑明刚%毕元兑%王玲%孙修勤%刘峰%王波
鄭明剛%畢元兌%王玲%孫脩勤%劉峰%王波
정명강%필원태%왕령%손수근%류봉%왕파
皱纹盘鲍%生物信息学%表达序列标签%神经肽Y受体
皺紋盤鮑%生物信息學%錶達序列標籤%神經肽Y受體
추문반포%생물신식학%표체서렬표첨%신경태Y수체
通过构建皱纹盘鲍(Haliotis discus Hannai)cDNA文库并进行大规模测序,获得了1282条高质量的ESTs序列,对这些序列进行拼接,获得了包括650条序列在内的244组片段重叠群(Contigs)和632个单一序列(Singletons).使用BlastX软件对876个Unigenes(Unigerie为Coiltig和Singleton的总和)进行同源性对比,有393个获得了功能提示,占总基因数的45%.根据EST信息,采用RACE方法.首次得到皱纹盘鲍神经肤Y(neuropeptide Y,NPY)受体基因,并对其结构进行了分析.结果表明,该受体基因cDNA由1534个核苷酸组成,编码区1050bp,可以编码350个氨基酸;该多肤的分子量为39.56kda,等电点为9.57,具有7个明显的跨膜螺旋且TM7区有NPXXY模体.
通過構建皺紋盤鮑(Haliotis discus Hannai)cDNA文庫併進行大規模測序,穫得瞭1282條高質量的ESTs序列,對這些序列進行拼接,穫得瞭包括650條序列在內的244組片段重疊群(Contigs)和632箇單一序列(Singletons).使用BlastX軟件對876箇Unigenes(Unigerie為Coiltig和Singleton的總和)進行同源性對比,有393箇穫得瞭功能提示,佔總基因數的45%.根據EST信息,採用RACE方法.首次得到皺紋盤鮑神經膚Y(neuropeptide Y,NPY)受體基因,併對其結構進行瞭分析.結果錶明,該受體基因cDNA由1534箇覈苷痠組成,編碼區1050bp,可以編碼350箇氨基痠;該多膚的分子量為39.56kda,等電點為9.57,具有7箇明顯的跨膜螺鏇且TM7區有NPXXY模體.
통과구건추문반포(Haliotis discus Hannai)cDNA문고병진행대규모측서,획득료1282조고질량적ESTs서렬,대저사서렬진행병접,획득료포괄650조서렬재내적244조편단중첩군(Contigs)화632개단일서렬(Singletons).사용BlastX연건대876개Unigenes(Unigerie위Coiltig화Singleton적총화)진행동원성대비,유393개획득료공능제시,점총기인수적45%.근거EST신식,채용RACE방법.수차득도추문반포신경부Y(neuropeptide Y,NPY)수체기인,병대기결구진행료분석.결과표명,해수체기인cDNA유1534개핵감산조성,편마구1050bp,가이편마350개안기산;해다부적분자량위39.56kda,등전점위9.57,구유7개명현적과막라선차TM7구유NPXXY모체.
