华南农业大学学报
華南農業大學學報
화남농업대학학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY
2005年
3期
93-95,99
,共4页
戚一达%余业东%孙彦伟%罗满林%贺东生%刘镇明
慼一達%餘業東%孫彥偉%囉滿林%賀東生%劉鎮明
척일체%여업동%손언위%라만림%하동생%류진명
猪圆环病毒2型%全基因序列%克隆%序列分析
豬圓環病毒2型%全基因序列%剋隆%序列分析
저원배병독2형%전기인서렬%극륭%서렬분석
根据GenBank中发表的已知猪圆环病毒2型(Porcine Circovirus-2,PCV-2)全基因序列,自行设计2对特异性引物,从2株接种疑似断乳仔猪多系统衰竭综合征(post-weaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)仔猪病料的PK-15细胞中提取基因组DNA,以此为模板,用PCR方法分2段扩增2个PCV-2广东株(GZ株和ZS株)的全基因序列. 应用序列分析软件DNAstar,对所测2组PCV-2序列与GenBank中的国内外PCV-2毒株进行同源性比较,并绘制系统进化发生树,进行了序列分析. 结果表明,2个PCV-2广东株全基因组皆为 1 767 bp,2个毒株间全基因序列核苷酸同源性为77.0%,第一开放阅读框(ORF1)间的核苷酸同源性仅为57.7%,而第二开放阅读框(ORF2)间的核苷酸同源性却高达99.1%. ZS株和GenBank中国内外其他的PCV-2参考毒株序列的核苷酸同源性在95.7%～99.5%之间;而GZ株和其他PCV-2参考毒株序列的核苷酸同源性仅在74.2%～77.1%之间.
根據GenBank中髮錶的已知豬圓環病毒2型(Porcine Circovirus-2,PCV-2)全基因序列,自行設計2對特異性引物,從2株接種疑似斷乳仔豬多繫統衰竭綜閤徵(post-weaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)仔豬病料的PK-15細胞中提取基因組DNA,以此為模闆,用PCR方法分2段擴增2箇PCV-2廣東株(GZ株和ZS株)的全基因序列. 應用序列分析軟件DNAstar,對所測2組PCV-2序列與GenBank中的國內外PCV-2毒株進行同源性比較,併繪製繫統進化髮生樹,進行瞭序列分析. 結果錶明,2箇PCV-2廣東株全基因組皆為 1 767 bp,2箇毒株間全基因序列覈苷痠同源性為77.0%,第一開放閱讀框(ORF1)間的覈苷痠同源性僅為57.7%,而第二開放閱讀框(ORF2)間的覈苷痠同源性卻高達99.1%. ZS株和GenBank中國內外其他的PCV-2參攷毒株序列的覈苷痠同源性在95.7%～99.5%之間;而GZ株和其他PCV-2參攷毒株序列的覈苷痠同源性僅在74.2%～77.1%之間.
근거GenBank중발표적이지저원배병독2형(Porcine Circovirus-2,PCV-2)전기인서렬,자행설계2대특이성인물,종2주접충의사단유자저다계통쇠갈종합정(post-weaning multisystemic wasting syndrome,PMWS)자저병료적PK-15세포중제취기인조DNA,이차위모판,용PCR방법분2단확증2개PCV-2엄동주(GZ주화ZS주)적전기인서렬. 응용서렬분석연건DNAstar,대소측2조PCV-2서렬여GenBank중적국내외PCV-2독주진행동원성비교,병회제계통진화발생수,진행료서렬분석. 결과표명,2개PCV-2엄동주전기인조개위 1 767 bp,2개독주간전기인서렬핵감산동원성위77.0%,제일개방열독광(ORF1)간적핵감산동원성부위57.7%,이제이개방열독광(ORF2)간적핵감산동원성각고체99.1%. ZS주화GenBank중국내외기타적PCV-2삼고독주서렬적핵감산동원성재95.7%～99.5%지간;이GZ주화기타PCV-2삼고독주서렬적핵감산동원성부재74.2%～77.1%지간.
