植物保护
植物保護
식물보호
PLANT PROTECTION
2012年
5期
100-104
,共5页
严婉荣%王铁霖%戴良英%杨玉文%王建玉%赵廷昌
嚴婉榮%王鐵霖%戴良英%楊玉文%王建玉%趙廷昌
엄완영%왕철림%대량영%양옥문%왕건옥%조정창
瓜类果斑病菌%致病基因%靶标基因
瓜類果斑病菌%緻病基因%靶標基因
과류과반병균%치병기인%파표기인
哈密瓜果斑病是严重危害瓜类的种传细菌性病害,其病原菌为嗜酸菌属西瓜种(Acidovoraxc citrulli).本文首先用Bioedit软件建立瓜类果斑病菌全氨基酸序列本地资源库,运用比较基因组学的方法,通过大量查找嗜酸菌属、欧文氏菌属、假单胞菌属、黄单胞菌属、劳尔氏菌属、土壤杆菌属、木质部小菌属中的致病基因和参考文献中已报道的致病基因,下载相关致病基因的氨基酸序列,与瓜类果斑病菌的全氨基酸序列进行localblast,取E＜10-5的为候选基因,得到果斑病菌中与致病性相关的基因,并对未知蛋白进行产物预测.同时,根据已经公布的靶标基因,用同样的比对方法,得到果斑病菌中潜在的靶标基因.本研究通过保守估计,得到77个致病性相关蛋白,预测了其中7个未知蛋白的产物,得到46个靶标蛋白.致病基因和靶标基因的分析预测,对以后研究此类基因提供了指导作用,为更好地防治该病害提供了理论基础.
哈密瓜果斑病是嚴重危害瓜類的種傳細菌性病害,其病原菌為嗜痠菌屬西瓜種(Acidovoraxc citrulli).本文首先用Bioedit軟件建立瓜類果斑病菌全氨基痠序列本地資源庫,運用比較基因組學的方法,通過大量查找嗜痠菌屬、歐文氏菌屬、假單胞菌屬、黃單胞菌屬、勞爾氏菌屬、土壤桿菌屬、木質部小菌屬中的緻病基因和參攷文獻中已報道的緻病基因,下載相關緻病基因的氨基痠序列,與瓜類果斑病菌的全氨基痠序列進行localblast,取E＜10-5的為候選基因,得到果斑病菌中與緻病性相關的基因,併對未知蛋白進行產物預測.同時,根據已經公佈的靶標基因,用同樣的比對方法,得到果斑病菌中潛在的靶標基因.本研究通過保守估計,得到77箇緻病性相關蛋白,預測瞭其中7箇未知蛋白的產物,得到46箇靶標蛋白.緻病基因和靶標基因的分析預測,對以後研究此類基因提供瞭指導作用,為更好地防治該病害提供瞭理論基礎.
합밀과과반병시엄중위해과류적충전세균성병해,기병원균위기산균속서과충(Acidovoraxc citrulli).본문수선용Bioedit연건건립과류과반병균전안기산서렬본지자원고,운용비교기인조학적방법,통과대량사조기산균속、구문씨균속、가단포균속、황단포균속、로이씨균속、토양간균속、목질부소균속중적치병기인화삼고문헌중이보도적치병기인,하재상관치병기인적안기산서렬,여과류과반병균적전안기산서렬진행localblast,취E＜10-5적위후선기인,득도과반병균중여치병성상관적기인,병대미지단백진행산물예측.동시,근거이경공포적파표기인,용동양적비대방법,득도과반병균중잠재적파표기인.본연구통과보수고계,득도77개치병성상관단백,예측료기중7개미지단백적산물,득도46개파표단백.치병기인화파표기인적분석예측,대이후연구차류기인제공료지도작용,위경호지방치해병해제공료이론기출.
