畜牧兽医学报
畜牧獸醫學報
축목수의학보
2009年
7期
1112-1119
,共8页
蔡铭升%程安春%汪铭书%朱德康%罗启慧%招丽婵%陈孝跃
蔡銘升%程安春%汪銘書%硃德康%囉啟慧%招麗嬋%陳孝躍
채명승%정안춘%왕명서%주덕강%라계혜%초려선%진효약
鸭瘟病毒%VP26基因%克隆%分子特性
鴨瘟病毒%VP26基因%剋隆%分子特性
압온병독%VP26기인%극륭%분자특성
利用作者实验室已构建的DPV CHv株基因文库重组质粒的DNA测序信息,结合NCBI的ORF Finder和BLAST工具分析得到了编码该病毒VP26蛋白基因(UL35)的ORF,然后采用PCR扩增出了VP26基因并将其克隆到pMDl8-T载体上,经PCR和酶切鉴定以及进一步的核酸斑点杂交试验证实该基因即为DPV的VP26基因.分子特性分析表明:该基因大小为354 bp,编码117 aa,包含1个保守结构域,为Herpes_UL35,与小衣壳蛋白家族相关并在Herpes_UL35基因编码蛋白之间高度保守,而且DPV VP26蛋白与GenBank上多种a疱疹病毒同源蛋白的核酸和氨基酸序列具有较高的同源性.系统进化树分析表明,DPV在分类地位上归属于Alphaherpesvirus亚科,而且有可能属于新的属.另外,亚细胞定位分析表明,VP26主要定位于细胞核中.密码子偏爱性分析结果显示,编码VP26相同氨基酸的不同密码子使用频率有较大的差异,DPV VP26与大肠杆菌、酵母和人的密码子使用偏爱性差异分别有18、19和25个.上述研究结果为进一步研究DPV VP26蛋白的功能和作用机理提供分子生物学依据.
利用作者實驗室已構建的DPV CHv株基因文庫重組質粒的DNA測序信息,結閤NCBI的ORF Finder和BLAST工具分析得到瞭編碼該病毒VP26蛋白基因(UL35)的ORF,然後採用PCR擴增齣瞭VP26基因併將其剋隆到pMDl8-T載體上,經PCR和酶切鑒定以及進一步的覈痠斑點雜交試驗證實該基因即為DPV的VP26基因.分子特性分析錶明:該基因大小為354 bp,編碼117 aa,包含1箇保守結構域,為Herpes_UL35,與小衣殼蛋白傢族相關併在Herpes_UL35基因編碼蛋白之間高度保守,而且DPV VP26蛋白與GenBank上多種a皰疹病毒同源蛋白的覈痠和氨基痠序列具有較高的同源性.繫統進化樹分析錶明,DPV在分類地位上歸屬于Alphaherpesvirus亞科,而且有可能屬于新的屬.另外,亞細胞定位分析錶明,VP26主要定位于細胞覈中.密碼子偏愛性分析結果顯示,編碼VP26相同氨基痠的不同密碼子使用頻率有較大的差異,DPV VP26與大腸桿菌、酵母和人的密碼子使用偏愛性差異分彆有18、19和25箇.上述研究結果為進一步研究DPV VP26蛋白的功能和作用機理提供分子生物學依據.
이용작자실험실이구건적DPV CHv주기인문고중조질립적DNA측서신식,결합NCBI적ORF Finder화BLAST공구분석득도료편마해병독VP26단백기인(UL35)적ORF,연후채용PCR확증출료VP26기인병장기극륭도pMDl8-T재체상,경PCR화매절감정이급진일보적핵산반점잡교시험증실해기인즉위DPV적VP26기인.분자특성분석표명:해기인대소위354 bp,편마117 aa,포함1개보수결구역,위Herpes_UL35,여소의각단백가족상관병재Herpes_UL35기인편마단백지간고도보수,이차DPV VP26단백여GenBank상다충a포진병독동원단백적핵산화안기산서렬구유교고적동원성.계통진화수분석표명,DPV재분류지위상귀속우Alphaherpesvirus아과,이차유가능속우신적속.령외,아세포정위분석표명,VP26주요정위우세포핵중.밀마자편애성분석결과현시,편마VP26상동안기산적불동밀마자사용빈솔유교대적차이,DPV VP26여대장간균、효모화인적밀마자사용편애성차이분별유18、19화25개.상술연구결과위진일보연구DPV VP26단백적공능화작용궤리제공분자생물학의거.
