蚕业科学
蠶業科學
잠업과학
ACTA SERICOLOGICA SINICA
2012年
2期
232-240
,共9页
张彩霞%鲍忠赞%徐世清%周前凯%魏广兵%王华%刘腾%金鑫%司马杨虎
張綵霞%鮑忠讚%徐世清%週前凱%魏廣兵%王華%劉騰%金鑫%司馬楊虎
장채하%포충찬%서세청%주전개%위엄병%왕화%류등%금흠%사마양호
家蚕%基因表达系列分析文库%正反交%差异表达基因%功能
傢蠶%基因錶達繫列分析文庫%正反交%差異錶達基因%功能
가잠%기인표체계렬분석문고%정반교%차이표체기인%공능
家蚕杂交组合存在普遍的正反交遗传表型差异现象,为探讨引起正反交组合遗传差异的分子机制,构建家蚕品种75新×7532正交F1代雌雄个体和7532×75新反交F1代雌雄个体共4个基因表达系列分析(SAGE)文库.通过正反交组合同性别子代样本间的比较,显示低表达的标签在种类上占大多数,而高表达的标签在数量上占绝对优势.以错误检测率(FDR)≤0.001且拷贝数倍数差异在2倍以上作为比较样本筛选差异表达基因(DEGs)的条件,在7532×75新的雄性样本里面有298个上调基因和46个下调基因,而在雌性样本里有453个上调基因和240个下调基因.进一步对差异表达基因进行GO和KEGG路径功能分析,筛选出在显著性富集路径中的差异表达基因,其中参与新陈代谢途径、氧化磷酸化途径以及信号传导途径的差异基因在反交组合的子代中表达明显上调.
傢蠶雜交組閤存在普遍的正反交遺傳錶型差異現象,為探討引起正反交組閤遺傳差異的分子機製,構建傢蠶品種75新×7532正交F1代雌雄箇體和7532×75新反交F1代雌雄箇體共4箇基因錶達繫列分析(SAGE)文庫.通過正反交組閤同性彆子代樣本間的比較,顯示低錶達的標籤在種類上佔大多數,而高錶達的標籤在數量上佔絕對優勢.以錯誤檢測率(FDR)≤0.001且拷貝數倍數差異在2倍以上作為比較樣本篩選差異錶達基因(DEGs)的條件,在7532×75新的雄性樣本裏麵有298箇上調基因和46箇下調基因,而在雌性樣本裏有453箇上調基因和240箇下調基因.進一步對差異錶達基因進行GO和KEGG路徑功能分析,篩選齣在顯著性富集路徑中的差異錶達基因,其中參與新陳代謝途徑、氧化燐痠化途徑以及信號傳導途徑的差異基因在反交組閤的子代中錶達明顯上調.
가잠잡교조합존재보편적정반교유전표형차이현상,위탐토인기정반교조합유전차이적분자궤제,구건가잠품충75신×7532정교F1대자웅개체화7532×75신반교F1대자웅개체공4개기인표체계렬분석(SAGE)문고.통과정반교조합동성별자대양본간적비교,현시저표체적표첨재충류상점대다수,이고표체적표첨재수량상점절대우세.이착오검측솔(FDR)≤0.001차고패수배수차이재2배이상작위비교양본사선차이표체기인(DEGs)적조건,재7532×75신적웅성양본리면유298개상조기인화46개하조기인,이재자성양본리유453개상조기인화240개하조기인.진일보대차이표체기인진행GO화KEGG로경공능분석,사선출재현저성부집로경중적차이표체기인,기중삼여신진대사도경、양화린산화도경이급신호전도도경적차이기인재반교조합적자대중표체명현상조.
