植物遗传资源学报
植物遺傳資源學報
식물유전자원학보
JOURNAL OF PLANT GENETLC RESOURCES
2009年
1期
97-102
,共6页
基因型数据%二元型数据%数据转换软件%遗传多样性分析
基因型數據%二元型數據%數據轉換軟件%遺傳多樣性分析
기인형수거%이원형수거%수거전환연건%유전다양성분석
遗传多样性研究是植物种质资源有效利用和保护的重要基础.遗传多样性研究所采用的分子标记工具主要有显性和共显性两种,两种不同类型的分子标记将产生不同的数据类型.显性分子标记产生二元型数据,共显性分子标记产生基因型数据.数据形式不同给遗传多样性的分析和研究带来多方面的困难,不同类型数据之间的互相比较也需要将基因型数据进行二元型转换.本研究基于Excel平台,设计开发了将基因型数据转换成二元型数据的处理软件.该软件按照基因型数据向二元型数据转换的原理,可以将庞大的分子标记基因型数据矩阵,迅速、高效、准确地转换成二元型(0、1)数据矩阵.利用显性分子标记ISSR和共显性分子标记SSR对野生大豆居群遗传多样性的案例分析表明,将共显性分子标记的基因型数据转换为二元型数据,有利于种质资源遗传多样性研究中不同分子标记获取的遗传多样性结果之间的比较和综合分析.
遺傳多樣性研究是植物種質資源有效利用和保護的重要基礎.遺傳多樣性研究所採用的分子標記工具主要有顯性和共顯性兩種,兩種不同類型的分子標記將產生不同的數據類型.顯性分子標記產生二元型數據,共顯性分子標記產生基因型數據.數據形式不同給遺傳多樣性的分析和研究帶來多方麵的睏難,不同類型數據之間的互相比較也需要將基因型數據進行二元型轉換.本研究基于Excel平檯,設計開髮瞭將基因型數據轉換成二元型數據的處理軟件.該軟件按照基因型數據嚮二元型數據轉換的原理,可以將龐大的分子標記基因型數據矩陣,迅速、高效、準確地轉換成二元型(0、1)數據矩陣.利用顯性分子標記ISSR和共顯性分子標記SSR對野生大豆居群遺傳多樣性的案例分析錶明,將共顯性分子標記的基因型數據轉換為二元型數據,有利于種質資源遺傳多樣性研究中不同分子標記穫取的遺傳多樣性結果之間的比較和綜閤分析.
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