四川动物
四川動物
사천동물
SICHUAN JOURNAL OF ZOOLOGY
2012年
3期
383-386,392
,共5页
刘洋%刘少英%孙治宇%范振鑫%侯全芬
劉洋%劉少英%孫治宇%範振鑫%侯全芬
류양%류소영%손치우%범진흠%후전분
细胞色素b%分子鉴定%偶蹄目%鹿科%牛科
細胞色素b%分子鑒定%偶蹄目%鹿科%牛科
세포색소b%분자감정%우제목%록과%우과
测定了3例来自四川崇州的疑似偶蹄目动物样本细胞色素b基因(Cyt b),利用NCBI数据库中的BLAST 功能对目标序列进行相似性搜索,发现与所测序列相似性高的分别为偶蹄目鹿科毛冠鹿Elaphodus cephalophus和牛科台湾鬣羚Capricornis swinhoei;联合下载四川有分布偶蹄目动物4科19种以及l条台湾鬣羚Cyt b基因序列进行系统发育关系重建分析,结果显示有两例待鉴定样本(4#、5#)以置信度值100与毛冠鹿聚在一起;另一例待鉴定样本(1彬#)对应序列和鬣羚Capricornis milneedwardii聚在一起后与台湾鬣羚形成姊妹关系,然后以置信度值100和斑羚Naemorhedus griseus又形成姊妹关系.因此,3例疑似偶蹄目动物有2例可能为毛冠鹿,1例可能为鬣羚;在MEGA4.0软件中以Kimura 2-parameter模型计算2例疑似为毛冠鹿(4#、5#)的目标序列与GenBank上毛冠鹿及赤麂Muntiacus muntjak、小麂Murtiacus reevesi序列间的遗传距离,发现两例疑似为毛冠鹿个体间遗传距离为0,2例疑似为毛冠鹿样本序列和下载的毛冠鹿序列间的遗传距离小(0.017),和赤麂、小麂间遗传距离大(0.119~0.120、0.116 ~0.119);1例疑似鬣羚(1#)的样本和下载鬣羚序列间遗传距离很小(0.006 ~0.009),和台湾鬣羚的遗传距离较大(0.043),和斑羚遗传距离更大(0.098).结合四川有分布偶蹄目状况,认为3例待鉴定样本2例可能为毛冠鹿,1例可能是鬣羚.
測定瞭3例來自四川崇州的疑似偶蹄目動物樣本細胞色素b基因(Cyt b),利用NCBI數據庫中的BLAST 功能對目標序列進行相似性搜索,髮現與所測序列相似性高的分彆為偶蹄目鹿科毛冠鹿Elaphodus cephalophus和牛科檯灣鬣羚Capricornis swinhoei;聯閤下載四川有分佈偶蹄目動物4科19種以及l條檯灣鬣羚Cyt b基因序列進行繫統髮育關繫重建分析,結果顯示有兩例待鑒定樣本(4#、5#)以置信度值100與毛冠鹿聚在一起;另一例待鑒定樣本(1彬#)對應序列和鬣羚Capricornis milneedwardii聚在一起後與檯灣鬣羚形成姊妹關繫,然後以置信度值100和斑羚Naemorhedus griseus又形成姊妹關繫.因此,3例疑似偶蹄目動物有2例可能為毛冠鹿,1例可能為鬣羚;在MEGA4.0軟件中以Kimura 2-parameter模型計算2例疑似為毛冠鹿(4#、5#)的目標序列與GenBank上毛冠鹿及赤麂Muntiacus muntjak、小麂Murtiacus reevesi序列間的遺傳距離,髮現兩例疑似為毛冠鹿箇體間遺傳距離為0,2例疑似為毛冠鹿樣本序列和下載的毛冠鹿序列間的遺傳距離小(0.017),和赤麂、小麂間遺傳距離大(0.119~0.120、0.116 ~0.119);1例疑似鬣羚(1#)的樣本和下載鬣羚序列間遺傳距離很小(0.006 ~0.009),和檯灣鬣羚的遺傳距離較大(0.043),和斑羚遺傳距離更大(0.098).結閤四川有分佈偶蹄目狀況,認為3例待鑒定樣本2例可能為毛冠鹿,1例可能是鬣羚.
측정료3례래자사천숭주적의사우제목동물양본세포색소b기인(Cyt b),이용NCBI수거고중적BLAST 공능대목표서렬진행상사성수색,발현여소측서렬상사성고적분별위우제목록과모관록Elaphodus cephalophus화우과태만렵령Capricornis swinhoei;연합하재사천유분포우제목동물4과19충이급l조태만렵령Cyt b기인서렬진행계통발육관계중건분석,결과현시유량례대감정양본(4#、5#)이치신도치100여모관록취재일기;령일례대감정양본(1빈#)대응서렬화렵령Capricornis milneedwardii취재일기후여태만렵령형성자매관계,연후이치신도치100화반령Naemorhedus griseus우형성자매관계.인차,3례의사우제목동물유2례가능위모관록,1례가능위렵령;재MEGA4.0연건중이Kimura 2-parameter모형계산2례의사위모관록(4#、5#)적목표서렬여GenBank상모관록급적궤Muntiacus muntjak、소궤Murtiacus reevesi서렬간적유전거리,발현량례의사위모관록개체간유전거리위0,2례의사위모관록양본서렬화하재적모관록서렬간적유전거리소(0.017),화적궤、소궤간유전거리대(0.119~0.120、0.116 ~0.119);1례의사렵령(1#)적양본화하재렵령서렬간유전거리흔소(0.006 ~0.009),화태만렵령적유전거리교대(0.043),화반령유전거리경대(0.098).결합사천유분포우제목상황,인위3례대감정양본2례가능위모관록,1례가능시렵령.