山地农业生物学报
山地農業生物學報
산지농업생물학보
JOURNAL OF MOUNTAIN AGRICULTURE AND BIOLOGY
2008年
4期
335-339
,共5页
代淑燕%程振涛%汪德生%文明%周碧君
代淑燕%程振濤%汪德生%文明%週碧君
대숙연%정진도%왕덕생%문명%주벽군
鸭肠炎病毒%核衣壳蛋白%二级结构%B细胞抗原表位
鴨腸炎病毒%覈衣殼蛋白%二級結構%B細胞抗原錶位
압장염병독%핵의각단백%이급결구%B세포항원표위
为预测和分析鸭肠炎病毒NP蛋白的二级结构和B细胞表位,以DEV-NP基因推导的氨基酸序列为基础,采用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法预测该蛋白二级结构;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案预测其B细胞抗原表位.结果表明,DEV-NP蛋白的二级结构较为复杂,含有较多的转角、无规则卷曲等柔性区域以及α-螺旋与β-折叠区段,且在蛋白肽链中有多个区段可形成B细胞抗原表位,其中第10~15和182~186区段及其附近可能是DEV-NP蛋白的B细胞表位优势区.
為預測和分析鴨腸炎病毒NP蛋白的二級結構和B細胞錶位,以DEV-NP基因推導的氨基痠序列為基礎,採用Chou-Fasman法、Ganmier-Robson法和Karplus-Schulz法預測該蛋白二級結構;按Kyte-Doolittle方案、Emini方案和Jameson-Wolf方案預測其B細胞抗原錶位.結果錶明,DEV-NP蛋白的二級結構較為複雜,含有較多的轉角、無規則捲麯等柔性區域以及α-螺鏇與β-摺疊區段,且在蛋白肽鏈中有多箇區段可形成B細胞抗原錶位,其中第10~15和182~186區段及其附近可能是DEV-NP蛋白的B細胞錶位優勢區.
위예측화분석압장염병독NP단백적이급결구화B세포표위,이DEV-NP기인추도적안기산서렬위기출,채용Chou-Fasman법、Ganmier-Robson법화Karplus-Schulz법예측해단백이급결구;안Kyte-Doolittle방안、Emini방안화Jameson-Wolf방안예측기B세포항원표위.결과표명,DEV-NP단백적이급결구교위복잡,함유교다적전각、무규칙권곡등유성구역이급α-라선여β-절첩구단,차재단백태련중유다개구단가형성B세포항원표위,기중제10~15화182~186구단급기부근가능시DEV-NP단백적B세포표위우세구.