科学通报
科學通報
과학통보
CHINESE SCIENCE BULLETIN
2006年
14期
1654-1665
,共12页
薛宇%刘丹%符传孩%窦震%周庆%姚雪彪
薛宇%劉丹%符傳孩%竇震%週慶%姚雪彪
설우%류단%부전해%두진%주경%요설표
驱动蛋白%比较基因组学%CENP-E%全长驱动蛋白预测方法(FKPP)
驅動蛋白%比較基因組學%CENP-E%全長驅動蛋白預測方法(FKPP)
구동단백%비교기인조학%CENP-E%전장구동단백예측방법(FKPP)
提供了一种新颖的、基于比较基因组学方法的全长驱动蛋白预测方法(full-length kinesin prediction program,FKPP),用于哺乳动物中驱动蛋白质组的鉴定与研究.之前的预测认为,哺乳动物共含94个驱动蛋白,而用FKPP从哺乳动物的基因组中总共鉴定出134个可能的驱动蛋白基因.基于数据库中存在的片段序列,用FKPP鉴定出25个可能的全长驱动蛋白.此外,用FKPP方法发现人的动点马达蛋白CENP-E应包含2701个氨基酸,而不是当初根据克隆预测的2663个氨基酸.通过对CENP-E的cDNA进行重测序,并同时采用特异性识别FKPP预测的CENP-E多肽抗体予以实验评估,结果表明,FKPP预测的CENP-E氨基酸序列是正确的.为此,本研究利用FKPP对哺乳动物的驱动蛋白进行了重新分类.鉴于目前公共数据库含有较多非全长序列的蛋白片段,FKPP可提供一个具有显著效率且准确新颖的全长序列预测手段,用于驱动蛋白以及其他蛋白家族的分子鉴定.
提供瞭一種新穎的、基于比較基因組學方法的全長驅動蛋白預測方法(full-length kinesin prediction program,FKPP),用于哺乳動物中驅動蛋白質組的鑒定與研究.之前的預測認為,哺乳動物共含94箇驅動蛋白,而用FKPP從哺乳動物的基因組中總共鑒定齣134箇可能的驅動蛋白基因.基于數據庫中存在的片段序列,用FKPP鑒定齣25箇可能的全長驅動蛋白.此外,用FKPP方法髮現人的動點馬達蛋白CENP-E應包含2701箇氨基痠,而不是噹初根據剋隆預測的2663箇氨基痠.通過對CENP-E的cDNA進行重測序,併同時採用特異性識彆FKPP預測的CENP-E多肽抗體予以實驗評估,結果錶明,FKPP預測的CENP-E氨基痠序列是正確的.為此,本研究利用FKPP對哺乳動物的驅動蛋白進行瞭重新分類.鑒于目前公共數據庫含有較多非全長序列的蛋白片段,FKPP可提供一箇具有顯著效率且準確新穎的全長序列預測手段,用于驅動蛋白以及其他蛋白傢族的分子鑒定.
제공료일충신영적、기우비교기인조학방법적전장구동단백예측방법(full-length kinesin prediction program,FKPP),용우포유동물중구동단백질조적감정여연구.지전적예측인위,포유동물공함94개구동단백,이용FKPP종포유동물적기인조중총공감정출134개가능적구동단백기인.기우수거고중존재적편단서렬,용FKPP감정출25개가능적전장구동단백.차외,용FKPP방법발현인적동점마체단백CENP-E응포함2701개안기산,이불시당초근거극륭예측적2663개안기산.통과대CENP-E적cDNA진행중측서,병동시채용특이성식별FKPP예측적CENP-E다태항체여이실험평고,결과표명,FKPP예측적CENP-E안기산서렬시정학적.위차,본연구이용FKPP대포유동물적구동단백진행료중신분류.감우목전공공수거고함유교다비전장서렬적단백편단,FKPP가제공일개구유현저효솔차준학신영적전장서렬예측수단,용우구동단백이급기타단백가족적분자감정.
