CAJ | 학술논문

目的分析人N-甲基-D-门冬氨酸受体(NMDAR)主亚基NR1a上两个受体激活相关多肽P1、P2的抗原性及其理化特性.方法用GOLDKEY软件从蛋白质数据库中调出人NR1a分子的氨基酸序列,分别在其第一、第三跨膜域前后逆向、顺向截取151和144个氨基酸长度的多肽片段P1与P2,选取Hopp ＆ Woods与Kyte亲水性、Janin表面可及性、Karplus-Schulz主链柔韧性及Welling抗原性等参数予以多参数分析,采用Prosite程序与Chou-Fasman方法比较其氨基酸位点与二级结构特征,以此为基础综合判定P1与P2片段的抗原位点并与已有的实验结果相比较.结果 P1、P2多肽片段上可能分别有6和7个8～15 aa长序列具有良好的抗原性.P1相关序列主要分布于其氨基端,与配体结合关键氨基酸残基相距较远.P2上的相关序列分布较均匀,包含有受体激活重要相关位点或与配体结合关键氨基酸残基距离较近.P2片段的总体抗原性、亲水性与可及性均强于P1,尤以其近膜的15个残基为著.P1、P2多肽片段均含有一定数量的β-转角,但P1片段含有较多的半胱氨酸残基和无规卷曲,而P2片段则含有较多的芳香族残基并以α螺旋结构为主.结论人NMDAR主亚基NR1a上的两个受体激活相关多肽P1、P2均具有一定数量的抗原位点,与P1相比较,P2可能更易成为NMDAR免疫干预的分子靶点.
목적분석인N-갑기-D-문동안산수체(NMDAR)주아기NR1a상량개수체격활상관다태P1、P2적항원성급기이화특성.방법용GOLDKEY연건종단백질수거고중조출인NR1a분자적안기산서렬,분별재기제일、제삼과막역전후역향、순향절취151화144개안기산장도적다태편단P1여P2,선취Hopp ＆ Woods여Kyte친수성、Janin표면가급성、Karplus-Schulz주련유인성급Welling항원성등삼수여이다삼수분석,채용Prosite정서여Chou-Fasman방법비교기안기산위점여이급결구특정,이차위기출종합판정P1여P2편단적항원위점병여이유적실험결과상비교.결과 P1、P2다태편단상가능분별유6화7개8～15 aa장서렬구유량호적항원성.P1상관서렬주요분포우기안기단,여배체결합관건안기산잔기상거교원.P2상적상관서렬분포교균균,포함유수체격활중요상관위점혹여배체결합관건안기산잔기거리교근.P2편단적총체항원성、친수성여가급성균강우P1,우이기근막적15개잔기위저.P1、P2다태편단균함유일정수량적β-전각,단P1편단함유교다적반광안산잔기화무규권곡,이P2편단칙함유교다적방향족잔기병이α라선결구위주.결론인NMDAR주아기NR1a상적량개수체격활상관다태P1、P2균구유일정수량적항원위점,여P1상비교,P2가능경역성위NMDAR면역간예적분자파점.