基因组学与应用生物学
基因組學與應用生物學
기인조학여응용생물학
GENOMICS AND APPLIED BIOLOGY
2011年
3期
288-295
,共8页
韦友传%高谦%昌明先%罗廷荣
韋友傳%高謙%昌明先%囉廷榮
위우전%고겸%창명선%라정영
斜带石斑鱼%表达%髓样分化因子88(MyD88)
斜帶石斑魚%錶達%髓樣分化因子88(MyD88)
사대석반어%표체%수양분화인자88(MyD88)
本研究运用RACE-PCR技术获得斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)髓样分化因子88 (myeloid differentiation factor 88,MyD88)基因,并对该基因进行生物信息学和表达模式分析.研究结果表明1 795 bp的cDNA全长序列,包括ORF 870 bp、5' UTR 243 bp和3' UTR 682 bp,3' UTR存在1个多聚腺苷酸加尾信号(AATAAA)和两个mRNA不稳定基序(ATTTA).SMART软件预测该蛋白N端和C端分别存在死亡结构域和TIR结构域(Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR);与其它脊椎动物MyD88的序列同一性达57.1%～78.7%;用NJ法构建的系统进化树中,斜带石斑鱼MyD88和其它已报导的鱼类MyD88聚为一枝.qPCR检测结果显示MyD88基因mRNA主要表达于肝脏、脾脏、头肾和胸腺等组织.本研究为进一步探讨MyD88在斜带石斑鱼TLR信号传导中的作用奠定基础.
本研究運用RACE-PCR技術穫得斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)髓樣分化因子88 (myeloid differentiation factor 88,MyD88)基因,併對該基因進行生物信息學和錶達模式分析.研究結果錶明1 795 bp的cDNA全長序列,包括ORF 870 bp、5' UTR 243 bp和3' UTR 682 bp,3' UTR存在1箇多聚腺苷痠加尾信號(AATAAA)和兩箇mRNA不穩定基序(ATTTA).SMART軟件預測該蛋白N耑和C耑分彆存在死亡結構域和TIR結構域(Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR);與其它脊椎動物MyD88的序列同一性達57.1%～78.7%;用NJ法構建的繫統進化樹中,斜帶石斑魚MyD88和其它已報導的魚類MyD88聚為一枝.qPCR檢測結果顯示MyD88基因mRNA主要錶達于肝髒、脾髒、頭腎和胸腺等組織.本研究為進一步探討MyD88在斜帶石斑魚TLR信號傳導中的作用奠定基礎.
본연구운용RACE-PCR기술획득사대석반어(Epinephelus coioides)수양분화인자88 (myeloid differentiation factor 88,MyD88)기인,병대해기인진행생물신식학화표체모식분석.연구결과표명1 795 bp적cDNA전장서렬,포괄ORF 870 bp、5' UTR 243 bp화3' UTR 682 bp,3' UTR존재1개다취선감산가미신호(AATAAA)화량개mRNA불은정기서(ATTTA).SMART연건예측해단백N단화C단분별존재사망결구역화TIR결구역(Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR);여기타척추동물MyD88적서렬동일성체57.1%～78.7%;용NJ법구건적계통진화수중,사대석반어MyD88화기타이보도적어류MyD88취위일지.qPCR검측결과현시MyD88기인mRNA주요표체우간장、비장、두신화흉선등조직.본연구위진일보탐토MyD88재사대석반어TLR신호전도중적작용전정기출.
