CAJ | 학술논문

应用生物信息学软件对获得的节旋藻硝酸盐转运蛋白基因(Amnrt P)全长序列进行了结构特征、同源性比较、多序列比对、系统发育学分析等.结果表明:该基因全长为1515 个核苷酸,编码 504 个氨基酸,平均 GC 含量为43.8%,疏水氨基酸的比例为47.6%.该硝酸盐转运蛋白含有 12 个跨膜结构域(Transmembrane domains,Tm),膜拓扑结构与 NRT2 家族的类似,并发现了多个 NRT2 家族的保守序列.同源性搜索显示与属于 NRT2 基因家族的海洋蓝藻的氨基酸序列相似性为75%～89%.采用邻接法(NJ)、最大简约法(MP)和最大似然法(ML)构建了分子系统树,结果表明 3 种树的拓扑结构基本相似,并且在蓝藻中基于硝酸盐转运蛋白基因的系统发育关系与形态学分类结果相一致.所获 Amnrt P 基因属于 NRT2 基因家族,可成为蓝藻系统进化研究的分子标记,并为了解节旋藻中硝酸盐吸收与转运的基因结构和分子机制奠定了一定的基础.
응용생물신식학연건대획득적절선조초산염전운단백기인(Amnrt P)전장서렬진행료결구특정、동원성비교、다서렬비대、계통발육학분석등.결과표명:해기인전장위1515 개핵감산,편마 504 개안기산,평균 GC 함량위43.8%,소수안기산적비례위47.6%.해초산염전운단백함유 12 개과막결구역(Transmembrane domains,Tm),막탁복결구여 NRT2 가족적유사,병발현료다개 NRT2 가족적보수서렬.동원성수색현시여속우 NRT2 기인가족적해양람조적안기산서렬상사성위75%～89%.채용린접법(NJ)、최대간약법(MP)화최대사연법(ML)구건료분자계통수,결과표명 3 충수적탁복결구기본상사,병차재람조중기우초산염전운단백기인적계통발육관계여형태학분류결과상일치.소획 Amnrt P 기인속우 NRT2 기인가족,가성위람조계통진화연구적분자표기,병위료해절선조중초산염흡수여전운적기인결구화분자궤제전정료일정적기출.