物理化学学报
物理化學學報
물이화학학보
ACTA PHYSICO-CHIMICA SINICA
2009年
4期
645-654
,共10页
孙倪悦%陆涛%陈亚东%郝兰虎%许岩%李瑞君
孫倪悅%陸濤%陳亞東%郝蘭虎%許巖%李瑞君
손예열%륙도%진아동%학란호%허암%리서군
细胞周期蛋白激酶%吲哚咔唑衍生物%3D-QSAR%3D-QSSR%比较分子力场分析方法%分子对接
細胞週期蛋白激酶%吲哚咔唑衍生物%3D-QSAR%3D-QSSR%比較分子力場分析方法%分子對接
세포주기단백격매%신타잡서연생물%3D-QSAR%3D-QSSR%비교분자력장분석방법%분자대접
细胞周期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年来治疗肿瘤的重要靶标.由于大多数激酶ATP结合位点的保守性,CDK选择性激酶抑制剂的开发成为当前的研发难点和热点.针对吲哚咔唑类CDK抑制剂,我们采用比较分子力场分析方法(CoMFA)建立了CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交叉验证系数q2分别为0.722和0.703;非交叉验证系数r2分别为0.977和0.946,表明其具有较好的预测能力.同时,用分子对接的方法分析了这类化合物与CDK4同源模建结构的作用模式,根据这两个模型发现,吲哚咔唑类化合物的R5和R6位长链取代对CDK4的选择性具有一定的影响,而且结合其作用模式比较合理地解释了这类抑制剂的选择性原因,这对CDKs的选择性研究具有一定的指导意义.
細胞週期蛋白激酶(cyclin-dependent kinases,CDKs)是近年來治療腫瘤的重要靶標.由于大多數激酶ATP結閤位點的保守性,CDK選擇性激酶抑製劑的開髮成為噹前的研髮難點和熱點.針對吲哚咔唑類CDK抑製劑,我們採用比較分子力場分析方法(CoMFA)建立瞭CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)和CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)模型.所建模型的交扠驗證繫數q2分彆為0.722和0.703;非交扠驗證繫數r2分彆為0.977和0.946,錶明其具有較好的預測能力.同時,用分子對接的方法分析瞭這類化閤物與CDK4同源模建結構的作用模式,根據這兩箇模型髮現,吲哚咔唑類化閤物的R5和R6位長鏈取代對CDK4的選擇性具有一定的影響,而且結閤其作用模式比較閤理地解釋瞭這類抑製劑的選擇性原因,這對CDKs的選擇性研究具有一定的指導意義.
세포주기단백격매(cyclin-dependent kinases,CDKs)시근년래치료종류적중요파표.유우대다수격매ATP결합위점적보수성,CDK선택성격매억제제적개발성위당전적연발난점화열점.침대신타잡서류CDK억제제,아문채용비교분자력장분석방법(CoMFA)건립료CDK2-QSAR(quantitative structure-activity relationship)화CDK4-QSSR(quantitative structure-selectivity relationship)모형.소건모형적교차험증계수q2분별위0.722화0.703;비교차험증계수r2분별위0.977화0.946,표명기구유교호적예측능력.동시,용분자대접적방법분석료저류화합물여CDK4동원모건결구적작용모식,근거저량개모형발현,신타잡서류화합물적R5화R6위장련취대대CDK4적선택성구유일정적영향,이차결합기작용모식비교합리지해석료저류억제제적선택성원인,저대CDKs적선택성연구구유일정적지도의의.