生命科学研究
生命科學研究
생명과학연구
LIFE SCIENCE RESEARCH
2010年
6期
492-498
,共7页
张凤娟%朴香花%吴立刚%高必达
張鳳娟%樸香花%吳立剛%高必達
장봉연%박향화%오립강%고필체
microRNA%脱腺苷酸化%CAF1%POP2%进化分析
microRNA%脫腺苷痠化%CAF1%POP2%進化分析
microRNA%탈선감산화%CAF1%POP2%진화분석
MicroRNA(miRNA)参与调控高等真核生物中三分之一以上基因的表达,其中核酸酶CAF1(CCR4-associated factor 1)及其同源基因POP2在miRNA引发的mRNA 3'端多聚腺苷酸(poly(A))的脱腺苷酸化过程中起了关键作用.通过实时定量RT-PCR的方法检测了小鼠各个组织中CAF1和POP2的相对表达情况,发现CAF1和POP2的组织分布特征不同.大多数组织中CA F1的表达水平明显高于POP2,并且组织间差异很大,特别是在大脑、小脑以及睾丸组织中CAF1的表达量很高,而POP2的表达量和变化幅度都较低.蛋白质序列比对发现,CAF1和POP2是一类进化过程中高度保守的核酸外切酶,在酵母、线虫、果蝇和尾索动物代表物种海鞘中都只存在单一基因,而进化到鱼类后产生了两个同源基因--CAF1和POP2,其中CAF1的氨基酸序列保守性较POP2更高,更加接近于原始的单一序列.CAF1和POP2这一对同源基因氨基酸序列的主要差别在蛋白质的C端.鱼类中POP2的C端序列同CAF1的序列较为接近,而在爬行动物之后POP2产生了与CAF1具有明显差异的C端序列,并逐渐趋于稳定.我们的分析结果同已有的功能研究一致,表明可能在miRNA产生后的进化过程中产生了CAF1和POP2两个同源基因,其中CAF1主要担负miRNA调控mRNA脱腺苷酸化的功能,而POP2可能主要参与其它不同的调控作用.
MicroRNA(miRNA)參與調控高等真覈生物中三分之一以上基因的錶達,其中覈痠酶CAF1(CCR4-associated factor 1)及其同源基因POP2在miRNA引髮的mRNA 3'耑多聚腺苷痠(poly(A))的脫腺苷痠化過程中起瞭關鍵作用.通過實時定量RT-PCR的方法檢測瞭小鼠各箇組織中CAF1和POP2的相對錶達情況,髮現CAF1和POP2的組織分佈特徵不同.大多數組織中CA F1的錶達水平明顯高于POP2,併且組織間差異很大,特彆是在大腦、小腦以及睪汍組織中CAF1的錶達量很高,而POP2的錶達量和變化幅度都較低.蛋白質序列比對髮現,CAF1和POP2是一類進化過程中高度保守的覈痠外切酶,在酵母、線蟲、果蠅和尾索動物代錶物種海鞘中都隻存在單一基因,而進化到魚類後產生瞭兩箇同源基因--CAF1和POP2,其中CAF1的氨基痠序列保守性較POP2更高,更加接近于原始的單一序列.CAF1和POP2這一對同源基因氨基痠序列的主要差彆在蛋白質的C耑.魚類中POP2的C耑序列同CAF1的序列較為接近,而在爬行動物之後POP2產生瞭與CAF1具有明顯差異的C耑序列,併逐漸趨于穩定.我們的分析結果同已有的功能研究一緻,錶明可能在miRNA產生後的進化過程中產生瞭CAF1和POP2兩箇同源基因,其中CAF1主要擔負miRNA調控mRNA脫腺苷痠化的功能,而POP2可能主要參與其它不同的調控作用.
MicroRNA(miRNA)삼여조공고등진핵생물중삼분지일이상기인적표체,기중핵산매CAF1(CCR4-associated factor 1)급기동원기인POP2재miRNA인발적mRNA 3'단다취선감산(poly(A))적탈선감산화과정중기료관건작용.통과실시정량RT-PCR적방법검측료소서각개조직중CAF1화POP2적상대표체정황,발현CAF1화POP2적조직분포특정불동.대다수조직중CA F1적표체수평명현고우POP2,병차조직간차이흔대,특별시재대뇌、소뇌이급고환조직중CAF1적표체량흔고,이POP2적표체량화변화폭도도교저.단백질서렬비대발현,CAF1화POP2시일류진화과정중고도보수적핵산외절매,재효모、선충、과승화미색동물대표물충해초중도지존재단일기인,이진화도어류후산생료량개동원기인--CAF1화POP2,기중CAF1적안기산서렬보수성교POP2경고,경가접근우원시적단일서렬.CAF1화POP2저일대동원기인안기산서렬적주요차별재단백질적C단.어류중POP2적C단서렬동CAF1적서렬교위접근,이재파행동물지후POP2산생료여CAF1구유명현차이적C단서렬,병축점추우은정.아문적분석결과동이유적공능연구일치,표명가능재miRNA산생후적진화과정중산생료CAF1화POP2량개동원기인,기중CAF1주요담부miRNA조공mRNA탈선감산화적공능,이POP2가능주요삼여기타불동적조공작용.