生物数学学报
生物數學學報
생물수학학보
JOURNAL OF BIOMATHEMATICS
2007年
1期
46-52
,共7页
董骝焕%袁媛%沈世镒%孙保存%倪春生
董騮煥%袁媛%瀋世鎰%孫保存%倪春生
동류환%원원%침세일%손보존%예춘생
线性微分方程模型%基因网络%三次样条插值
線性微分方程模型%基因網絡%三次樣條插值
선성미분방정모형%기인망락%삼차양조삽치
随着基因芯片的技术的推广,越来越多的表达数据需要被处理和分析.利用这些表达数据提取基因调控矩阵从而构建基因网络是一个重要的问题.通过线性微分方程模型可以初步构建基因网络,了解网络结构,提取最显著的信息.然而由于分子生物学的条件限制或者数据来源的限制,导致实验数据不充分,使方程组无解.本文使用三次样条方法,对26例临床、病理资料完备的具有淋巴结转移的乳腺癌基因表达数据进行插值处理,使表达数据满秩,从而使用最小二乘法解出加权矩阵,构建初步的表达基因调控网络.通过对构建的基因网络的初步分析表明:乳腺癌转移的形成是由多基因异常引起多条传导通路异常,致使细胞恶性转化的结果,这与生物学上公认的看法是相一致的.因此,利用此线性模型方法对基因表达谱进行分析具有一定可行性,在认识乳腺癌转移机制,乳腺癌诊断和治疗方面具有一定的理论和应用价值.
隨著基因芯片的技術的推廣,越來越多的錶達數據需要被處理和分析.利用這些錶達數據提取基因調控矩陣從而構建基因網絡是一箇重要的問題.通過線性微分方程模型可以初步構建基因網絡,瞭解網絡結構,提取最顯著的信息.然而由于分子生物學的條件限製或者數據來源的限製,導緻實驗數據不充分,使方程組無解.本文使用三次樣條方法,對26例臨床、病理資料完備的具有淋巴結轉移的乳腺癌基因錶達數據進行插值處理,使錶達數據滿秩,從而使用最小二乘法解齣加權矩陣,構建初步的錶達基因調控網絡.通過對構建的基因網絡的初步分析錶明:乳腺癌轉移的形成是由多基因異常引起多條傳導通路異常,緻使細胞噁性轉化的結果,這與生物學上公認的看法是相一緻的.因此,利用此線性模型方法對基因錶達譜進行分析具有一定可行性,在認識乳腺癌轉移機製,乳腺癌診斷和治療方麵具有一定的理論和應用價值.
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