免疫学杂志
免疫學雜誌
면역학잡지
IMMUNOLOGICAL JOURNAL
2007年
4期
440-444,448
,共6页
张梦军%周鹏%李声时%肖正华%邓金
張夢軍%週鵬%李聲時%肖正華%鄧金
장몽군%주붕%리성시%초정화%산금
SSX-1%SSX-4%氨基酸非键作用指数%HLA-A*0201%CTL表位%定量构效关系
SSX-1%SSX-4%氨基痠非鍵作用指數%HLA-A*0201%CTL錶位%定量構效關繫
SSX-1%SSX-4%안기산비건작용지수%HLA-A*0201%CTL표위%정량구효관계
目的 预测SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位.方法 从分子的三维空间结构出发,基于静电、立体、疏水这三类与生物活性直接相关的非键作用方式,经主成分分析技术(PCA)得到了一种新的分子结构表达方法--氨基酸非键作用指数.利用该指数结合偏最小二乘(PLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行了定量构效关系(QSAR)建模,再使用该模型对SSX-1和SSX-4抗原HLA.A*0201限制性表位进行预测.结果 预测出8个活性值大于7的九肽表位.结论 通过对SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的预测,从而为SSX-1和SSD-4抗原HLA-A*0201限制性表位的实验探测和鉴定打下了基础.
目的 預測SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限製性錶位.方法 從分子的三維空間結構齣髮,基于靜電、立體、疏水這三類與生物活性直接相關的非鍵作用方式,經主成分分析技術(PCA)得到瞭一種新的分子結構錶達方法--氨基痠非鍵作用指數.利用該指數結閤偏最小二乘(PLS)算法對152箇HLA-A*0201限製性CTL錶位進行瞭定量構效關繫(QSAR)建模,再使用該模型對SSX-1和SSX-4抗原HLA.A*0201限製性錶位進行預測.結果 預測齣8箇活性值大于7的九肽錶位.結論 通過對SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限製性錶位的預測,從而為SSX-1和SSD-4抗原HLA-A*0201限製性錶位的實驗探測和鑒定打下瞭基礎.
목적 예측SSX-1화SSX-4항원HLA-A*0201한제성표위.방법 종분자적삼유공간결구출발,기우정전、입체、소수저삼류여생물활성직접상관적비건작용방식,경주성분분석기술(PCA)득도료일충신적분자결구표체방법--안기산비건작용지수.이용해지수결합편최소이승(PLS)산법대152개HLA-A*0201한제성CTL표위진행료정량구효관계(QSAR)건모,재사용해모형대SSX-1화SSX-4항원HLA.A*0201한제성표위진행예측.결과 예측출8개활성치대우7적구태표위.결론 통과대SSX-1화SSX-4항원HLA-A*0201한제성표위적예측,종이위SSX-1화SSD-4항원HLA-A*0201한제성표위적실험탐측화감정타하료기출.
