中国农学通报
中國農學通報
중국농학통보
CHINESE AGRICULTURAL SCIENCE BULLETIN
2012年
17期
5-11
,共7页
刘璐%苏玉虹%王军%赵会仁%袁志发
劉璐%囌玉虹%王軍%趙會仁%袁誌髮
류로%소옥홍%왕군%조회인%원지발
猪肉%pH值%QTL%Meta分析
豬肉%pH值%QTL%Meta分析
저육%pH치%QTL%Meta분석
为了整合与优化猪肉pH值相关数量性状位点(quantitative trait loci,QTL),为分子标记辅助选择奠定基础,采用Meta分析,整合猪pH相关QTL,并对已知候选基因与“真实”QTL(MQTL)进行关联.收集猪肉pH值相关QTL,将其映射到美国肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公布的猪遗传连锁图谱,构建新的整合图谱,新图谱中的QTL簇经Meta分析,聚合为MQTL.进一步将已知候选基因映射到整合图谱,比较候选基因与各“真实”QTL的位置差异,分析其关联性.结果显示:224个原始QTL聚合成37个QTL簇,通过Meta分析,得到37个MQTL.MQTL的95%置信区间1.35~25.32 cM,相比原始QTL缩短29.20%~92.36%.其中,MQTL35、MQTL16、MQTL10、MQTL4和MQTL17的置信区间均在5 cM以内,且分别是由7、8、4、5、7个QTL聚合而成,具有较高的精确度和一致性.LYZ、RYR1、VTN、MYPN和PRKAG3基因映射到整合图谱后,分别定位在MQTL13、MQTL18、MQTL29、MQTL32和MQTL34置信区间内,可将其作为关键区域,开展深入研究工作.
為瞭整閤與優化豬肉pH值相關數量性狀位點(quantitative trait loci,QTL),為分子標記輔助選擇奠定基礎,採用Meta分析,整閤豬pH相關QTL,併對已知候選基因與“真實”QTL(MQTL)進行關聯.收集豬肉pH值相關QTL,將其映射到美國肉畜研究中心(USDA-MARC2.0)公佈的豬遺傳連鎖圖譜,構建新的整閤圖譜,新圖譜中的QTL簇經Meta分析,聚閤為MQTL.進一步將已知候選基因映射到整閤圖譜,比較候選基因與各“真實”QTL的位置差異,分析其關聯性.結果顯示:224箇原始QTL聚閤成37箇QTL簇,通過Meta分析,得到37箇MQTL.MQTL的95%置信區間1.35~25.32 cM,相比原始QTL縮短29.20%~92.36%.其中,MQTL35、MQTL16、MQTL10、MQTL4和MQTL17的置信區間均在5 cM以內,且分彆是由7、8、4、5、7箇QTL聚閤而成,具有較高的精確度和一緻性.LYZ、RYR1、VTN、MYPN和PRKAG3基因映射到整閤圖譜後,分彆定位在MQTL13、MQTL18、MQTL29、MQTL32和MQTL34置信區間內,可將其作為關鍵區域,開展深入研究工作.
위료정합여우화저육pH치상관수량성상위점(quantitative trait loci,QTL),위분자표기보조선택전정기출,채용Meta분석,정합저pH상관QTL,병대이지후선기인여“진실”QTL(MQTL)진행관련.수집저육pH치상관QTL,장기영사도미국육축연구중심(USDA-MARC2.0)공포적저유전련쇄도보,구건신적정합도보,신도보중적QTL족경Meta분석,취합위MQTL.진일보장이지후선기인영사도정합도보,비교후선기인여각“진실”QTL적위치차이,분석기관련성.결과현시:224개원시QTL취합성37개QTL족,통과Meta분석,득도37개MQTL.MQTL적95%치신구간1.35~25.32 cM,상비원시QTL축단29.20%~92.36%.기중,MQTL35、MQTL16、MQTL10、MQTL4화MQTL17적치신구간균재5 cM이내,차분별시유7、8、4、5、7개QTL취합이성,구유교고적정학도화일치성.LYZ、RYR1、VTN、MYPN화PRKAG3기인영사도정합도보후,분별정위재MQTL13、MQTL18、MQTL29、MQTL32화MQTL34치신구간내,가장기작위관건구역,개전심입연구공작.