遗传
遺傳
유전
HEREDITAS(BEIJING)
2012年
11期
1456-1464
,共9页
三角帆蚌%GPX基因%SNP%抗性性状
三角帆蚌%GPX基因%SNP%抗性性狀
삼각범방%GPX기인%SNP%항성성상
根据三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)谷胱甘肽过氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因 cDNA 序列,通过 PCR 和基因组步移法,从三角帆蚌基因组 DNA 中扩增出 GPX 基因全长及其 5′调控区.序列分析表明,该基因序列全长 6 708 bp,含有 2 个外显子,1 个内含子.5′调控区为 992 bp,含有启动子的核心序列 TATA 盒 以及其他一些转录调控元件,如 AP1、C/EBP、CdxA.2 个外显子长度分别为 273 bp 和 991 bp,内含子长度为 4 491 bp.通过直接测序法在三角帆蚌抗性群体和易感群体中筛选 GPX 基因的 SNPs,并研究这些多态性位点 与抗逆性状的相关性.共获得了 16 个 SNP 位点,其中启动子区的 A-99G 位点、A-86C 位点、A-49C 位点,内 含子区的 A2841T 位点、C2847T 位点、G3146C 位点、A3150G 位点以及 G4645T 位点共 8 个 SNP 位点的基因 型频率和等位基因频率在抗性和易感群体中均存在显著性差异(P<0.05).连锁不平衡分析结果显示 GPX 基因 A-86C 位点、A-49C 位点、C2847T 位点、A3150G 位点与 G4645T 位点之间,以及 A2841T 位点与 G3146C 位 点之间均存在强连锁不平衡.同时单倍型分析发现,在抗性群体中单倍型分别为 ACTGT 和 TG 的个体出现的 频率显著高于易感群体中出现的频率.这些结果表明,GPX 基因的部分 SNPs 可作为三角帆蚌抗病辅助育种的 候选分子标记.
根據三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)穀胱甘肽過氧化物酶(Glutathione peroxidase,GPX)基因 cDNA 序列,通過 PCR 和基因組步移法,從三角帆蚌基因組 DNA 中擴增齣 GPX 基因全長及其 5′調控區.序列分析錶明,該基因序列全長 6 708 bp,含有 2 箇外顯子,1 箇內含子.5′調控區為 992 bp,含有啟動子的覈心序列 TATA 盒 以及其他一些轉錄調控元件,如 AP1、C/EBP、CdxA.2 箇外顯子長度分彆為 273 bp 和 991 bp,內含子長度為 4 491 bp.通過直接測序法在三角帆蚌抗性群體和易感群體中篩選 GPX 基因的 SNPs,併研究這些多態性位點 與抗逆性狀的相關性.共穫得瞭 16 箇 SNP 位點,其中啟動子區的 A-99G 位點、A-86C 位點、A-49C 位點,內 含子區的 A2841T 位點、C2847T 位點、G3146C 位點、A3150G 位點以及 G4645T 位點共 8 箇 SNP 位點的基因 型頻率和等位基因頻率在抗性和易感群體中均存在顯著性差異(P<0.05).連鎖不平衡分析結果顯示 GPX 基因 A-86C 位點、A-49C 位點、C2847T 位點、A3150G 位點與 G4645T 位點之間,以及 A2841T 位點與 G3146C 位 點之間均存在彊連鎖不平衡.同時單倍型分析髮現,在抗性群體中單倍型分彆為 ACTGT 和 TG 的箇體齣現的 頻率顯著高于易感群體中齣現的頻率.這些結果錶明,GPX 基因的部分 SNPs 可作為三角帆蚌抗病輔助育種的 候選分子標記.
근거삼각범방(Hyriopsis cumingii)곡광감태과양화물매(Glutathione peroxidase,GPX)기인 cDNA 서렬,통과 PCR 화기인조보이법,종삼각범방기인조 DNA 중확증출 GPX 기인전장급기 5′조공구.서렬분석표명,해기인서렬전장 6 708 bp,함유 2 개외현자,1 개내함자.5′조공구위 992 bp,함유계동자적핵심서렬 TATA 합 이급기타일사전록조공원건,여 AP1、C/EBP、CdxA.2 개외현자장도분별위 273 bp 화 991 bp,내함자장도위 4 491 bp.통과직접측서법재삼각범방항성군체화역감군체중사선 GPX 기인적 SNPs,병연구저사다태성위점 여항역성상적상관성.공획득료 16 개 SNP 위점,기중계동자구적 A-99G 위점、A-86C 위점、A-49C 위점,내 함자구적 A2841T 위점、C2847T 위점、G3146C 위점、A3150G 위점이급 G4645T 위점공 8 개 SNP 위점적기인 형빈솔화등위기인빈솔재항성화역감군체중균존재현저성차이(P<0.05).련쇄불평형분석결과현시 GPX 기인 A-86C 위점、A-49C 위점、C2847T 위점、A3150G 위점여 G4645T 위점지간,이급 A2841T 위점여 G3146C 위 점지간균존재강련쇄불평형.동시단배형분석발현,재항성군체중단배형분별위 ACTGT 화 TG 적개체출현적 빈솔현저고우역감군체중출현적빈솔.저사결과표명,GPX 기인적부분 SNPs 가작위삼각범방항병보조육충적 후선분자표기.
