病毒学报
病毒學報
병독학보
CHINESE JOURNAL OF VIROLOGY
2005年
2期
131-135
,共5页
曾首英%张奇亚%严兴洪%蔡生力
曾首英%張奇亞%嚴興洪%蔡生力
증수영%장기아%엄흥홍%채생력
淋巴囊肿病毒中国株%虹彩病毒%羟类固醇脱氢酶%病毒基因结构分析
淋巴囊腫病毒中國株%虹綵病毒%羥類固醇脫氫酶%病毒基因結構分析
림파낭종병독중국주%홍채병독%간류고순탈경매%병독기인결구분석
属于虹彩病毒科的淋巴囊肿病毒(Lymphocystis disease virus,LCDV)是一类能引起全球各地上百种淡、海水鱼产生囊肿的病原.在新分离到淋巴囊肿病毒中国株(Lymphocystis disease virus isolate from China,LCDV-C)并完成序列测定的基础上,用计算机辅助分析了LCDV-C羟类固醇脱氢酶(hydroxysteroid dehvdrogenase,HSD)基因结构特征,LCDV-C HSD读码框为1 023bp,推导其编码含340个氨基酸、分子量约为39.3kD的蛋白质.对来自10个不同病毒株或物种的HSD蛋白序列进行的比较分析显示,LCDV-C与淋巴囊肿病毒代表株(LCDV-1)的HSD氨基酸同源性最高,为60.5%.对LCDV-C HSD的二级结构进行了预测,有亲水区5个,抗原区、α螺旋区和β折叠区各有6个.经密度排列界面(dense alignment surface,DAS)的方法预测,表明LCDV-C HSD有一个跨膜结构域.
屬于虹綵病毒科的淋巴囊腫病毒(Lymphocystis disease virus,LCDV)是一類能引起全毬各地上百種淡、海水魚產生囊腫的病原.在新分離到淋巴囊腫病毒中國株(Lymphocystis disease virus isolate from China,LCDV-C)併完成序列測定的基礎上,用計算機輔助分析瞭LCDV-C羥類固醇脫氫酶(hydroxysteroid dehvdrogenase,HSD)基因結構特徵,LCDV-C HSD讀碼框為1 023bp,推導其編碼含340箇氨基痠、分子量約為39.3kD的蛋白質.對來自10箇不同病毒株或物種的HSD蛋白序列進行的比較分析顯示,LCDV-C與淋巴囊腫病毒代錶株(LCDV-1)的HSD氨基痠同源性最高,為60.5%.對LCDV-C HSD的二級結構進行瞭預測,有親水區5箇,抗原區、α螺鏇區和β摺疊區各有6箇.經密度排列界麵(dense alignment surface,DAS)的方法預測,錶明LCDV-C HSD有一箇跨膜結構域.
속우홍채병독과적림파낭종병독(Lymphocystis disease virus,LCDV)시일류능인기전구각지상백충담、해수어산생낭종적병원.재신분리도림파낭종병독중국주(Lymphocystis disease virus isolate from China,LCDV-C)병완성서렬측정적기출상,용계산궤보조분석료LCDV-C간류고순탈경매(hydroxysteroid dehvdrogenase,HSD)기인결구특정,LCDV-C HSD독마광위1 023bp,추도기편마함340개안기산、분자량약위39.3kD적단백질.대래자10개불동병독주혹물충적HSD단백서렬진행적비교분석현시,LCDV-C여림파낭종병독대표주(LCDV-1)적HSD안기산동원성최고,위60.5%.대LCDV-C HSD적이급결구진행료예측,유친수구5개,항원구、α라선구화β절첩구각유6개.경밀도배렬계면(dense alignment surface,DAS)적방법예측,표명LCDV-C HSD유일개과막결구역.
