生物信息学
生物信息學
생물신식학
BIOINFORMATICS
2010年
2期
91-97
,共7页
任鄄胜%肖培村%陈勇%吕启明%王玉平%赵慧霞%李仕贵
任鄄勝%肖培村%陳勇%呂啟明%王玉平%趙慧霞%李仕貴
임견성%초배촌%진용%려계명%왕옥평%조혜하%리사귀
抗病基因同源序列%基因模体分析%复制事件%转座子元件%基因组
抗病基因同源序列%基因模體分析%複製事件%轉座子元件%基因組
항병기인동원서렬%기인모체분석%복제사건%전좌자원건%기인조
利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因组数据库(TIGR Rice Genome Annotation - Release 5)中识别出565个编码抗病蛋白质的同源序列;利用识别出565个编码抗病蛋白质序列分别与籼稻基因组数据库进行BLASTP联配,共确定320个对应的等位基因.通过在线生物信息学软件,识别了这565个抗病基因的保守结构域、保守模体和DNA序列内转座子元件,其中有14个抗病基因同源序列注释错误.同时绘出了这些基因的基因组分布,并基于这些基因的同源树分析和基因组物理分布,认为基因的原位和远程复制事件产生了抗病基因的现存分布和多样性,其中转座子在复制过程中扮演了重要角色.这些对抗病机制研究和抗病基因进化研究以及抗病基因的转育具有重要意义.
利用模糊搜索的方法,在TIGR水稻日本晴基因組數據庫(TIGR Rice Genome Annotation - Release 5)中識彆齣565箇編碼抗病蛋白質的同源序列;利用識彆齣565箇編碼抗病蛋白質序列分彆與秈稻基因組數據庫進行BLASTP聯配,共確定320箇對應的等位基因.通過在線生物信息學軟件,識彆瞭這565箇抗病基因的保守結構域、保守模體和DNA序列內轉座子元件,其中有14箇抗病基因同源序列註釋錯誤.同時繪齣瞭這些基因的基因組分佈,併基于這些基因的同源樹分析和基因組物理分佈,認為基因的原位和遠程複製事件產生瞭抗病基因的現存分佈和多樣性,其中轉座子在複製過程中扮縯瞭重要角色.這些對抗病機製研究和抗病基因進化研究以及抗病基因的轉育具有重要意義.
이용모호수색적방법,재TIGR수도일본청기인조수거고(TIGR Rice Genome Annotation - Release 5)중식별출565개편마항병단백질적동원서렬;이용식별출565개편마항병단백질서렬분별여선도기인조수거고진행BLASTP련배,공학정320개대응적등위기인.통과재선생물신식학연건,식별료저565개항병기인적보수결구역、보수모체화DNA서렬내전좌자원건,기중유14개항병기인동원서렬주석착오.동시회출료저사기인적기인조분포,병기우저사기인적동원수분석화기인조물리분포,인위기인적원위화원정복제사건산생료항병기인적현존분포화다양성,기중전좌자재복제과정중분연료중요각색.저사대항병궤제연구화항병기인진화연구이급항병기인적전육구유중요의의.
