CAJ | 학술논문

采用反转录聚合酶链反应(RT-PCR)方法、生物信息学软件和质谱分析对中蜂囊状幼虫病毒(CSBV)辽宁株(CSBV-LN)全基时组进行了分子克隆、序列测定、分子生物学特性分析及结构蛋白预测和鉴定.结果表明,CSBV-LN全基因组序列长度为8863个核苷酸,编码一个大的开放阅读框,其中包括178 nt的5′非编码区的前导序列和79 nt的3′非编码区,后面跟着一个poly(A)的尾巴,通过软件分析表明,CSBV-LN蛋白序列类似于哺乳动物的小RNA病毒蛋白序列,预计存在VP1,VP2,VP3和VP4等4个小的结构蛋白;系统进化分析表明,CSBV、囊状幼虫病毒(SBV)和残翅病毒(DWV)的起源相同,推测CSBV有着类似DWV的结构蛋白序列5′-VP2-VP4VP1VP3-3.基于此,根据PAGE蛋白条带的大小,利用NetPicoRNA软件预测结构蛋白的裂解位点.在此基础上,对纯化后的CSBV进行SDS-PAGE分离,对分离到的4个蛋白进行质谱分析,结果鉴定出VP1,VP3和VP0 3个蛋白.
채용반전록취합매련반응(RT-PCR)방법、생물신식학연건화질보분석대중봉낭상유충병독(CSBV)료녕주(CSBV-LN)전기시조진행료분자극륭、서렬측정、분자생물학특성분석급결구단백예측화감정.결과표명,CSBV-LN전기인조서렬장도위8863개핵감산,편마일개대적개방열독광,기중포괄178 nt적5′비편마구적전도서렬화79 nt적3′비편마구,후면근착일개poly(A)적미파,통과연건분석표명,CSBV-LN단백서렬유사우포유동물적소RNA병독단백서렬,예계존재VP1,VP2,VP3화VP4등4개소적결구단백;계통진화분석표명,CSBV、낭상유충병독(SBV)화잔시병독(DWV)적기원상동,추측CSBV유착유사DWV적결구단백서렬5′-VP2-VP4VP1VP3-3.기우차,근거PAGE단백조대적대소,이용NetPicoRNA연건예측결구단백적렬해위점.재차기출상,대순화후적CSBV진행SDS-PAGE분리,대분리도적4개단백진행질보분석,결과감정출VP1,VP3화VP0 3개단백.