热带生物学报
熱帶生物學報
열대생물학보
JOURNAL OF SOUTH CHINA UNIVERSITY OF TROPICAL AGRICULTURE
2010年
1期
62-66
,共5页
吴瑞%朱家红%张全琪%张治礼
吳瑞%硃傢紅%張全琪%張治禮
오서%주가홍%장전기%장치례
巴西橡胶树%基因克隆%LIM基因%生物信息学
巴西橡膠樹%基因剋隆%LIM基因%生物信息學
파서상효수%기인극륭%LIM기인%생물신식학
根据乙烯利刺激巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)胶乳差异表达cDNA文库的EST序列信息,利用RACE技术从胶乳中成功克隆了1个含有LIM结构域的未知功能新基因HbLIM的全长cDNA.生物信息学分析表明,该基因全长cDNA由1 016 bp的碱基组成,拥有1个570 bp的开放阅读框编码189个氨基酸残基;推测氨基酸序列富含Lys,Ser,Ala和Leu,含有2个LIM结构域和2个N-豆蔻酰化位置.序列相似性分析表明, HbLIM编码的氨基酸序列与蓖麻、杨毛、葡萄相应的LIM基因的相似性高达98%,95% 和92%.这些研究结果为深入探讨LIM结构域蛋白在巴西橡胶树乳管发育及乳管代谢中的功能奠定了基础.
根據乙烯利刺激巴西橡膠樹(Hevea brasiliensis)膠乳差異錶達cDNA文庫的EST序列信息,利用RACE技術從膠乳中成功剋隆瞭1箇含有LIM結構域的未知功能新基因HbLIM的全長cDNA.生物信息學分析錶明,該基因全長cDNA由1 016 bp的堿基組成,擁有1箇570 bp的開放閱讀框編碼189箇氨基痠殘基;推測氨基痠序列富含Lys,Ser,Ala和Leu,含有2箇LIM結構域和2箇N-豆蔻酰化位置.序列相似性分析錶明, HbLIM編碼的氨基痠序列與蓖痳、楊毛、葡萄相應的LIM基因的相似性高達98%,95% 和92%.這些研究結果為深入探討LIM結構域蛋白在巴西橡膠樹乳管髮育及乳管代謝中的功能奠定瞭基礎.
근거을희리자격파서상효수(Hevea brasiliensis)효유차이표체cDNA문고적EST서렬신식,이용RACE기술종효유중성공극륭료1개함유LIM결구역적미지공능신기인HbLIM적전장cDNA.생물신식학분석표명,해기인전장cDNA유1 016 bp적감기조성,옹유1개570 bp적개방열독광편마189개안기산잔기;추측안기산서렬부함Lys,Ser,Ala화Leu,함유2개LIM결구역화2개N-두구선화위치.서렬상사성분석표명, HbLIM편마적안기산서렬여비마、양모、포도상응적LIM기인적상사성고체98%,95% 화92%.저사연구결과위심입탐토LIM결구역단백재파서상효수유관발육급유관대사중적공능전정료기출.