热带海洋学报
熱帶海洋學報
열대해양학보
JOURNAL OF TROPICAL OCEANOGRAPHY
2010年
3期
47-54
,共8页
曲妮妮%龚世园%黄桂菊%童金苟%喻达辉
麯妮妮%龔世園%黃桂菊%童金茍%喻達輝
곡니니%공세완%황계국%동금구%유체휘
FIASCO法%合浦珠母贝Pinctada fucata%微卫星标记%分离与筛选
FIASCO法%閤浦珠母貝Pinctada fucata%微衛星標記%分離與篩選
FIASCO법%합포주모패Pinctada fucata%미위성표기%분리여사선
用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技术开展了合浦珠母贝Pinctada fucata基因组微卫星标记的分离与筛选研究.合浦珠母贝基因组DNA经限制性内切酶MseI酶切后与接头连接, 用生物素标记的(CA)15探针与其杂交, 然后用磁珠富集、洗脱获得单链目的片段, 经PCR扩增后形成双链, 最后进行克隆转化, 构建微卫星富集文库.挑选克隆用探针引物(CA)15 和载体引物进行第2次筛选, 获得阳性克隆357个, 测序结果表明, 297个克隆(83.2%)含有微卫星序列, 包括479个微卫星DNA结构域.其中完美型微卫星有370个(77.3%), 非完美型95个(19.8%), 复合型14个(2.9%).合成引物49对, 有31对(63%)扩增出目的产物, 其中9 对在种群中(n=32)具有扩增多态性, 其多态信息含量PIC值在0.375―0.809之间, 平均为0.536;等位基因数在2―9个之间, 平均为4.889个;观测杂合度介于0.200―0.600之间, 平均为0.415;期望杂合度的变化范围为0.454―0.844, 平均为0.598.表明FIASCO技术适合于合浦珠母贝微卫星标记的分离与筛选.
用FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)技術開展瞭閤浦珠母貝Pinctada fucata基因組微衛星標記的分離與篩選研究.閤浦珠母貝基因組DNA經限製性內切酶MseI酶切後與接頭連接, 用生物素標記的(CA)15探針與其雜交, 然後用磁珠富集、洗脫穫得單鏈目的片段, 經PCR擴增後形成雙鏈, 最後進行剋隆轉化, 構建微衛星富集文庫.挑選剋隆用探針引物(CA)15 和載體引物進行第2次篩選, 穫得暘性剋隆357箇, 測序結果錶明, 297箇剋隆(83.2%)含有微衛星序列, 包括479箇微衛星DNA結構域.其中完美型微衛星有370箇(77.3%), 非完美型95箇(19.8%), 複閤型14箇(2.9%).閤成引物49對, 有31對(63%)擴增齣目的產物, 其中9 對在種群中(n=32)具有擴增多態性, 其多態信息含量PIC值在0.375―0.809之間, 平均為0.536;等位基因數在2―9箇之間, 平均為4.889箇;觀測雜閤度介于0.200―0.600之間, 平均為0.415;期望雜閤度的變化範圍為0.454―0.844, 平均為0.598.錶明FIASCO技術適閤于閤浦珠母貝微衛星標記的分離與篩選.
용FIASCO(Fast Isolation by AFLP of Sequences Containing Repeats)기술개전료합포주모패Pinctada fucata기인조미위성표기적분리여사선연구.합포주모패기인조DNA경한제성내절매MseI매절후여접두련접, 용생물소표기적(CA)15탐침여기잡교, 연후용자주부집、세탈획득단련목적편단, 경PCR확증후형성쌍련, 최후진행극륭전화, 구건미위성부집문고.도선극륭용탐침인물(CA)15 화재체인물진행제2차사선, 획득양성극륭357개, 측서결과표명, 297개극륭(83.2%)함유미위성서렬, 포괄479개미위성DNA결구역.기중완미형미위성유370개(77.3%), 비완미형95개(19.8%), 복합형14개(2.9%).합성인물49대, 유31대(63%)확증출목적산물, 기중9 대재충군중(n=32)구유확증다태성, 기다태신식함량PIC치재0.375―0.809지간, 평균위0.536;등위기인수재2―9개지간, 평균위4.889개;관측잡합도개우0.200―0.600지간, 평균위0.415;기망잡합도적변화범위위0.454―0.844, 평균위0.598.표명FIASCO기술괄합우합포주모패미위성표기적분리여사선.