动物医学进展
動物醫學進展
동물의학진전
PROGRESS IN VETERINARY MEDICINE
2007年
7期
102-106
,共5页
梁之昶%陈小玲%相磊%章振华%姚刚%杨兵
樑之昶%陳小玲%相磊%章振華%姚剛%楊兵
량지창%진소령%상뢰%장진화%요강%양병
16 S rRNA基因%致病菌%双序列比对%系统进化分析%仔猪
16 S rRNA基因%緻病菌%雙序列比對%繫統進化分析%仔豬
16 S rRNA기인%치병균%쌍서렬비대%계통진화분석%자저
研究仔猪12种致病菌的16 S rRNA基因序列,分析其亲缘关系,为设计其16 S rRNA基因的诊断探针提供理论依据.从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库中下载332条仔猪12种致病菌的16S rRNA基因序列,应用双序列比对和构建系统进化树的方法对这些序列进行种内分析,选出每种细菌的代表序列,再对代表序列用同法进行种间分析,并将种间分类结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类结果进行比较.从每种细菌的数据库中选出一条接近16 S rRNA基因序列全长,与同种其他序列的核苷酸替代率差异较小的序列为该种细菌的代表序列,进行种间16 S rRNA基因序列系统进化分析,结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类基本一致.该16 S rRNA基因的系统进化分析所提供的信息将用于下一步针对这12种致病菌的16 S rRNA基因诊断探针的设计.
研究仔豬12種緻病菌的16 S rRNA基因序列,分析其親緣關繫,為設計其16 S rRNA基因的診斷探針提供理論依據.從美國國傢生物技術信息中心(NCBI)基因庫中下載332條仔豬12種緻病菌的16S rRNA基因序列,應用雙序列比對和構建繫統進化樹的方法對這些序列進行種內分析,選齣每種細菌的代錶序列,再對代錶序列用同法進行種間分析,併將種間分類結果與伯傑氏細菌分類手冊(第8版)的分類結果進行比較.從每種細菌的數據庫中選齣一條接近16 S rRNA基因序列全長,與同種其他序列的覈苷痠替代率差異較小的序列為該種細菌的代錶序列,進行種間16 S rRNA基因序列繫統進化分析,結果與伯傑氏細菌分類手冊(第8版)的分類基本一緻.該16 S rRNA基因的繫統進化分析所提供的信息將用于下一步針對這12種緻病菌的16 S rRNA基因診斷探針的設計.
연구자저12충치병균적16 S rRNA기인서렬,분석기친연관계,위설계기16 S rRNA기인적진단탐침제공이론의거.종미국국가생물기술신식중심(NCBI)기인고중하재332조자저12충치병균적16S rRNA기인서렬,응용쌍서렬비대화구건계통진화수적방법대저사서렬진행충내분석,선출매충세균적대표서렬,재대대표서렬용동법진행충간분석,병장충간분류결과여백걸씨세균분류수책(제8판)적분류결과진행비교.종매충세균적수거고중선출일조접근16 S rRNA기인서렬전장,여동충기타서렬적핵감산체대솔차이교소적서렬위해충세균적대표서렬,진행충간16 S rRNA기인서렬계통진화분석,결과여백걸씨세균분류수책(제8판)적분류기본일치.해16 S rRNA기인적계통진화분석소제공적신식장용우하일보침대저12충치병균적16 S rRNA기인진단탐침적설계.
