激光生物学报
激光生物學報
격광생물학보
ACTA LASER BIOLOGY SINICA
2011年
5期
685-691
,共7页
宋书锋%徐国云%王曼玲%崔延春%夏新界
宋書鋒%徐國雲%王曼玲%崔延春%夏新界
송서봉%서국운%왕만령%최연춘%하신계
水稻%低温%芯片%克隆%表达谱
水稻%低溫%芯片%剋隆%錶達譜
수도%저온%심편%극륭%표체보
低温、高温、干旱等非生物胁迫是影响水稻产量与品质的重要非生物逆境因子.为了探索水稻耐逆的分子机理并挖掘新的水稻耐逆基因,采用Affymetrix 60K水稻基因表达芯片分析了培矮64S全基因组在上述逆境下的表达谱变化,筛选出一个受低温诱导表达水平显著升高的基因OsCR1( Oryza sativaL.cold responsive gene 1,GenBank登录号:AK066066).实时定量PCR进一步证实该基因受低温诱导高表达.利用RT-PCR方法扩增获得其cDNA序列.生物信息学分析表明,OsCR1位于水稻第10号染色体上,包含两个内含子并存在选择性剪接现象,可编码含195个氨基酸残基的蛋白质,其蛋白等电点为5.78,分子量为21.9 kD.拓扑结构预测显示OsCR1蛋白上含有2个Ser/Thr蛋白激酶磷酸化位点;疏水性分析显示该基因为亲水性蛋白;启动子区域分析发现5类逆境相关的顺式作用元件.氨基酸序列比对分析显示OsCR1为未知功能基因.
低溫、高溫、榦旱等非生物脅迫是影響水稻產量與品質的重要非生物逆境因子.為瞭探索水稻耐逆的分子機理併挖掘新的水稻耐逆基因,採用Affymetrix 60K水稻基因錶達芯片分析瞭培矮64S全基因組在上述逆境下的錶達譜變化,篩選齣一箇受低溫誘導錶達水平顯著升高的基因OsCR1( Oryza sativaL.cold responsive gene 1,GenBank登錄號:AK066066).實時定量PCR進一步證實該基因受低溫誘導高錶達.利用RT-PCR方法擴增穫得其cDNA序列.生物信息學分析錶明,OsCR1位于水稻第10號染色體上,包含兩箇內含子併存在選擇性剪接現象,可編碼含195箇氨基痠殘基的蛋白質,其蛋白等電點為5.78,分子量為21.9 kD.拓撲結構預測顯示OsCR1蛋白上含有2箇Ser/Thr蛋白激酶燐痠化位點;疏水性分析顯示該基因為親水性蛋白;啟動子區域分析髮現5類逆境相關的順式作用元件.氨基痠序列比對分析顯示OsCR1為未知功能基因.
저온、고온、간한등비생물협박시영향수도산량여품질적중요비생물역경인자.위료탐색수도내역적분자궤리병알굴신적수도내역기인,채용Affymetrix 60K수도기인표체심편분석료배왜64S전기인조재상술역경하적표체보변화,사선출일개수저온유도표체수평현저승고적기인OsCR1( Oryza sativaL.cold responsive gene 1,GenBank등록호:AK066066).실시정량PCR진일보증실해기인수저온유도고표체.이용RT-PCR방법확증획득기cDNA서렬.생물신식학분석표명,OsCR1위우수도제10호염색체상,포함량개내함자병존재선택성전접현상,가편마함195개안기산잔기적단백질,기단백등전점위5.78,분자량위21.9 kD.탁복결구예측현시OsCR1단백상함유2개Ser/Thr단백격매린산화위점;소수성분석현시해기인위친수성단백;계동자구역분석발현5류역경상관적순식작용원건.안기산서렬비대분석현시OsCR1위미지공능기인.