中华神经医学杂志
中華神經醫學雜誌
중화신경의학잡지
CHINESE JOURNAL OF NEUROMEDICINE
2011年
8期
794-796
,共3页
周烨%于云红%鲍勇%谢炜%李长征
週燁%于雲紅%鮑勇%謝煒%李長徵
주엽%우운홍%포용%사위%리장정
结节性硬化症%癫痫%基因芯片%生物信息学
結節性硬化癥%癲癇%基因芯片%生物信息學
결절성경화증%전간%기인심편%생물신식학
Tuberous scleroses complex%Epilepsy%DNA microarray%Bioinformatics
目的 用生物信息学方法探讨结节性硬化症与难治性癫痫的发病相关基因,为癫痫的基础研究和临床治疗提供新思路。 方法 从基因芯片公共数据库Gene Expression Omnibus(GEO)中下载结节性硬化症与难治性癫痫相关基因芯片数据,利用String、KEGG、Panther等在线分析软件对差异表达基因进行生物信息学分析。 结果 在100个差异表达基因所编码的蛋白中,有47个蛋白与其他蛋白存在相互作用关系,作用过程涉及多种生物学通路,与多个生物学过程和分子功能相关。 结论 结节性硬化症与难治性癫痫这二者发病是多种基因相互作用的结果,其中与GFAP、ANXA2和S100A 10等关系最为密切。
目的 用生物信息學方法探討結節性硬化癥與難治性癲癇的髮病相關基因,為癲癇的基礎研究和臨床治療提供新思路。 方法 從基因芯片公共數據庫Gene Expression Omnibus(GEO)中下載結節性硬化癥與難治性癲癇相關基因芯片數據,利用String、KEGG、Panther等在線分析軟件對差異錶達基因進行生物信息學分析。 結果 在100箇差異錶達基因所編碼的蛋白中,有47箇蛋白與其他蛋白存在相互作用關繫,作用過程涉及多種生物學通路,與多箇生物學過程和分子功能相關。 結論 結節性硬化癥與難治性癲癇這二者髮病是多種基因相互作用的結果,其中與GFAP、ANXA2和S100A 10等關繫最為密切。
목적 용생물신식학방법탐토결절성경화증여난치성전간적발병상관기인,위전간적기출연구화림상치료제공신사로。 방법 종기인심편공공수거고Gene Expression Omnibus(GEO)중하재결절성경화증여난치성전간상관기인심편수거,이용String、KEGG、Panther등재선분석연건대차이표체기인진행생물신식학분석。 결과 재100개차이표체기인소편마적단백중,유47개단백여기타단백존재상호작용관계,작용과정섭급다충생물학통로,여다개생물학과정화분자공능상관。 결론 결절성경화증여난치성전간저이자발병시다충기인상호작용적결과,기중여GFAP、ANXA2화S100A 10등관계최위밀절。
Objective To investigate the genes associated with tuberous scleroses complex and refractory epilepsy with bioinformatics methods to provide new ideas for the basic research and clinical treatment of epilepsy. Methods The microarray data of tuberous scleroses complex and refractory epilepsy were downloaded from the Gene Expression Omnibus (GEO) database and analyzed by bioinformatics methods using String, KEGG and Panther databases.Results Of all the 100 differentially expressed genes, 47 were found to encode proteins with interactions; they involved to multiple biological pathways, biological processes and molecular functions.Conclusion The pathogenesis of tuberous scleroses complex and refractory epilepsy involves multiple genes, such as GFAP, ANXA 2 and S100A 10.