山西农业科学
山西農業科學
산서농업과학
JOURNAL OF SHANXI AGRICULTURAL SCIENCES
2011年
4期
295-298,306
,共5页
烟草%序列表达标签(EST)%SSR%GSS%引物
煙草%序列錶達標籤(EST)%SSR%GSS%引物
연초%서렬표체표첨(EST)%SSR%GSS%인물
EST-SSR标记与gSSR标记是2种重要的分子标记,烟草EST序列数量与基因组序列数量的迅速增加为开发新的烟草分子标记提供了宝贵的数据资源.对GenBank上公布的158098条EST序列及10 647条GSS序列进行大规模微卫星位点搜索,在EST中发现了8 088个微卫星位点(检出率为5.1%),在GSS中发现了2 020个微卫星位点(检出率为18.9%).在EST中搜索到的重复单元共有176种,其中二核苷酸占主导地位,占到总SSR的近66%,出现次数在1～100之间的基序超过所有基序的90%;在GSS中搜索到重复单元81种,出现次数大部分在1～50之间,占88%.研究还挑选了烟草的150条EST序列,并对其进行了引物的设计.
EST-SSR標記與gSSR標記是2種重要的分子標記,煙草EST序列數量與基因組序列數量的迅速增加為開髮新的煙草分子標記提供瞭寶貴的數據資源.對GenBank上公佈的158098條EST序列及10 647條GSS序列進行大規模微衛星位點搜索,在EST中髮現瞭8 088箇微衛星位點(檢齣率為5.1%),在GSS中髮現瞭2 020箇微衛星位點(檢齣率為18.9%).在EST中搜索到的重複單元共有176種,其中二覈苷痠佔主導地位,佔到總SSR的近66%,齣現次數在1～100之間的基序超過所有基序的90%;在GSS中搜索到重複單元81種,齣現次數大部分在1～50之間,佔88%.研究還挑選瞭煙草的150條EST序列,併對其進行瞭引物的設計.
EST-SSR표기여gSSR표기시2충중요적분자표기,연초EST서렬수량여기인조서렬수량적신속증가위개발신적연초분자표기제공료보귀적수거자원.대GenBank상공포적158098조EST서렬급10 647조GSS서렬진행대규모미위성위점수색,재EST중발현료8 088개미위성위점(검출솔위5.1%),재GSS중발현료2 020개미위성위점(검출솔위18.9%).재EST중수색도적중복단원공유176충,기중이핵감산점주도지위,점도총SSR적근66%,출현차수재1～100지간적기서초과소유기서적90%;재GSS중수색도중복단원81충,출현차수대부분재1～50지간,점88%.연구환도선료연초적150조EST서렬,병대기진행료인물적설계.
