中国医药导刊
中國醫藥導刊
중국의약도간
CHINESE JOURNAL OF MEDICAL GUIDE
2010年
10期
1746-1748
,共3页
葛庆波%罗巧云%王真真%方兆庚%刘述
葛慶波%囉巧雲%王真真%方兆庚%劉述
갈경파%라교운%왕진진%방조경%류술
ROC曲线%乙酰胆碱酯酶%虚拟筛选%打分函数
ROC麯線%乙酰膽堿酯酶%虛擬篩選%打分函數
ROC곡선%을선담감지매%허의사선%타분함수
目的:将ROC曲线分析应用在计算机虚拟药物筛选研究领域中.方法:利用分子对接软件以乙酰胆碱酯酶的三维晶体结构为靶,虚拟筛选40个抑制剂和3 960个无活性化合物,利用5种打分函数(Surflex_score,D_score,G_score,PMF_score,ChemScore)对筛选结果打分排序,应用ROC曲线分析打分排序后的结果.结果:ROC曲线分析出利用ChemScore打分函数得出的曲线F的面积(AUC)最大,为0.91;如果特异度作为优先考虑因素时,应用ChemScore打分函数可以获得最多的活性化合物;如果灵敏度作为优先考虑冈素时,应用ChemScore打分函数也可以获得最多的活性化合物.结论:ROC曲线分析同时考虑到了灵敏度和特异度,在计算机虚拟药物筛选过程中,可以根据实际情况设定打分函数的阙值,获得尽可能多的活性化合物.
目的:將ROC麯線分析應用在計算機虛擬藥物篩選研究領域中.方法:利用分子對接軟件以乙酰膽堿酯酶的三維晶體結構為靶,虛擬篩選40箇抑製劑和3 960箇無活性化閤物,利用5種打分函數(Surflex_score,D_score,G_score,PMF_score,ChemScore)對篩選結果打分排序,應用ROC麯線分析打分排序後的結果.結果:ROC麯線分析齣利用ChemScore打分函數得齣的麯線F的麵積(AUC)最大,為0.91;如果特異度作為優先攷慮因素時,應用ChemScore打分函數可以穫得最多的活性化閤物;如果靈敏度作為優先攷慮岡素時,應用ChemScore打分函數也可以穫得最多的活性化閤物.結論:ROC麯線分析同時攷慮到瞭靈敏度和特異度,在計算機虛擬藥物篩選過程中,可以根據實際情況設定打分函數的闕值,穫得儘可能多的活性化閤物.
목적:장ROC곡선분석응용재계산궤허의약물사선연구영역중.방법:이용분자대접연건이을선담감지매적삼유정체결구위파,허의사선40개억제제화3 960개무활성화합물,이용5충타분함수(Surflex_score,D_score,G_score,PMF_score,ChemScore)대사선결과타분배서,응용ROC곡선분석타분배서후적결과.결과:ROC곡선분석출이용ChemScore타분함수득출적곡선F적면적(AUC)최대,위0.91;여과특이도작위우선고필인소시,응용ChemScore타분함수가이획득최다적활성화합물;여과령민도작위우선고필강소시,응용ChemScore타분함수야가이획득최다적활성화합물.결론:ROC곡선분석동시고필도료령민도화특이도,재계산궤허의약물사선과정중,가이근거실제정황설정타분함수적궐치,획득진가능다적활성화합물.