安徽农业科学
安徽農業科學
안휘농업과학
JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES
2008年
29期
12557-12559
,共3页
MM-PBSA%分子动力学%β-环糊精%雌二醇
MM-PBSA%分子動力學%β-環糊精%雌二醇
MM-PBSA%분자동역학%β-배호정%자이순
运用分子动力学和MM-PBSA相结合的方法预测β-环糊精和雌二醇包结模式.通过MD轨迹分析,不论是A-up取向还是D-up取向,雌二醇都可以和β-CD形成稳定的包结;通过氢键占有率的分析,发现β-CD的构象发生一定程度的变化.MM-PBSA计算结果表明,A-up取向包结自由能更低,为优势包结模式.进一步分析各个能量项可得,范德华相互作用能为包结的主要驱动力.
運用分子動力學和MM-PBSA相結閤的方法預測β-環糊精和雌二醇包結模式.通過MD軌跡分析,不論是A-up取嚮還是D-up取嚮,雌二醇都可以和β-CD形成穩定的包結;通過氫鍵佔有率的分析,髮現β-CD的構象髮生一定程度的變化.MM-PBSA計算結果錶明,A-up取嚮包結自由能更低,為優勢包結模式.進一步分析各箇能量項可得,範德華相互作用能為包結的主要驅動力.
운용분자동역학화MM-PBSA상결합적방법예측β-배호정화자이순포결모식.통과MD궤적분석,불론시A-up취향환시D-up취향,자이순도가이화β-CD형성은정적포결;통과경건점유솔적분석,발현β-CD적구상발생일정정도적변화.MM-PBSA계산결과표명,A-up취향포결자유능경저,위우세포결모식.진일보분석각개능량항가득,범덕화상호작용능위포결적주요구동력.
