华中农业大学学报
華中農業大學學報
화중농업대학학보
JOURNAL OF HUAZHONG AGRICULTURAL UNIVERSITY
2002年
6期
501-505
,共5页
方六荣%牛传双%肖少波%方兵兵%张辉%陈焕春
方六榮%牛傳雙%肖少波%方兵兵%張輝%陳煥春
방륙영%우전쌍%초소파%방병병%장휘%진환춘
猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)%ORF5基因%克隆%序列分析
豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒(PRRSV)%ORF5基因%剋隆%序列分析
저번식여호흡종합정병독(PRRSV)%ORF5기인%극륭%서렬분석
以猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)YA株为材料,采用RT-PCR扩增其ORF5基因全长cDNA并进行序列测定和比较分析.结果YA株ORF5基因cDNA编码区长603 bp,可编码200个氨基酸残基.与欧洲型代表株LV株、美洲型代表株VR-2332株在氨基酸水平上的同源性分别为58%和90%,与国内首株分离株(CH-1a)的同源性高达95%,推测YA株属于美洲型.根据YA株ORF5基因编码的氨基酸序列,与具有代表性的12株美洲型毒株和2株欧洲型毒株绘制进化系统树,结果也显示YA株与美洲型分离毒株的遗传关系较近,而与欧洲型毒株的遗传关系较远.进一步采用序列分析软件对推导的氨基酸进行比较分析,发现YA株ORF5编码的E蛋白存在5个潜在的N-糖基化位点,6个抗原位点,其糖基化位点的数目及抗原位点的分布与其它美洲型毒株均存在一定程度的差异,但3个最主要的抗原表位相对保守.
以豬繁殖與呼吸綜閤徵病毒(PRRSV)YA株為材料,採用RT-PCR擴增其ORF5基因全長cDNA併進行序列測定和比較分析.結果YA株ORF5基因cDNA編碼區長603 bp,可編碼200箇氨基痠殘基.與歐洲型代錶株LV株、美洲型代錶株VR-2332株在氨基痠水平上的同源性分彆為58%和90%,與國內首株分離株(CH-1a)的同源性高達95%,推測YA株屬于美洲型.根據YA株ORF5基因編碼的氨基痠序列,與具有代錶性的12株美洲型毒株和2株歐洲型毒株繪製進化繫統樹,結果也顯示YA株與美洲型分離毒株的遺傳關繫較近,而與歐洲型毒株的遺傳關繫較遠.進一步採用序列分析軟件對推導的氨基痠進行比較分析,髮現YA株ORF5編碼的E蛋白存在5箇潛在的N-糖基化位點,6箇抗原位點,其糖基化位點的數目及抗原位點的分佈與其它美洲型毒株均存在一定程度的差異,但3箇最主要的抗原錶位相對保守.
이저번식여호흡종합정병독(PRRSV)YA주위재료,채용RT-PCR확증기ORF5기인전장cDNA병진행서렬측정화비교분석.결과YA주ORF5기인cDNA편마구장603 bp,가편마200개안기산잔기.여구주형대표주LV주、미주형대표주VR-2332주재안기산수평상적동원성분별위58%화90%,여국내수주분리주(CH-1a)적동원성고체95%,추측YA주속우미주형.근거YA주ORF5기인편마적안기산서렬,여구유대표성적12주미주형독주화2주구주형독주회제진화계통수,결과야현시YA주여미주형분리독주적유전관계교근,이여구주형독주적유전관계교원.진일보채용서렬분석연건대추도적안기산진행비교분석,발현YA주ORF5편마적E단백존재5개잠재적N-당기화위점,6개항원위점,기당기화위점적수목급항원위점적분포여기타미주형독주균존재일정정도적차이,단3개최주요적항원표위상대보수.
