中山大学学报(自然科学版)
中山大學學報(自然科學版)
중산대학학보(자연과학판)
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS SUNYATSENI
2002年
5期
60-63
,共4页
符志彦%卢阳%叶兰汀%何智良%徐安龙
符誌彥%盧暘%葉蘭汀%何智良%徐安龍
부지언%로양%협란정%하지량%서안룡
cDNA分析系统%大规模测序%unix/linux操作系统%phred/phrap软件%stackpack软件%blast软件
cDNA分析繫統%大規模測序%unix/linux操作繫統%phred/phrap軟件%stackpack軟件%blast軟件
cDNA분석계통%대규모측서%unix/linux조작계통%phred/phrap연건%stackpack연건%blast연건
基于unix/linux操作系统和mysql数据库,利用phred/phrap, stackpack, blast软件,对cDNA和EST序列进行大规模自动分析.它可以完成从测序峰图文件向核酸序列的转化,去除载体污染和重复序列,序列聚类,拼接,分析可变剪切,数据库搜索进行相似性分析.该系统可以加速大规模EST测序的分析速度.
基于unix/linux操作繫統和mysql數據庫,利用phred/phrap, stackpack, blast軟件,對cDNA和EST序列進行大規模自動分析.它可以完成從測序峰圖文件嚮覈痠序列的轉化,去除載體汙染和重複序列,序列聚類,拼接,分析可變剪切,數據庫搜索進行相似性分析.該繫統可以加速大規模EST測序的分析速度.
기우unix/linux조작계통화mysql수거고,이용phred/phrap, stackpack, blast연건,대cDNA화EST서렬진행대규모자동분석.타가이완성종측서봉도문건향핵산서렬적전화,거제재체오염화중복서렬,서렬취류,병접,분석가변전절,수거고수색진행상사성분석.해계통가이가속대규모EST측서적분석속도.
