植物学通报
植物學通報
식물학통보
CHINESE BULLETIN OF BOTANY
2008年
1期
27-33
,共7页
AP2/EREBP%杂交分析%水稻%预测基因
AP2/EREBP%雜交分析%水稻%預測基因
AP2/EREBP%잡교분석%수도%예측기인
AP2/EREBP蛋白是广泛存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP 功能域的重要转录因子家族,通常可分为包含单功能域的EREBP类蛋白和包含两个功能域的 AP2类蛋白,它们的功能涉及植物生长发育调控和对逆境应答等许多方面.据预测,水稻基因组编码150个左右的AP2/EREBP 家族成员,但目前绝大多数蛋白的功能仍不清楚.为了解这些基因在水稻不同器官中的表达特性,我们以AP2/EREBP功能域的氨基酸序列为基础,从水稻基因组数据库中搜索到12个AP2类以及20个EREBP类预测基因 ,利用PCR扩增的编码区序列制备了这些预测基因的macro-array . 以幼芽、幼根、幼叶、颖花和灌浆期成熟叶的 cDNA为探针,杂交分析结果显示: 不同AP2类预测基因之间的表达量差别较大,但同一个基因在不同器官中表达量基本一致; 与此不同的是,大部分EREBP类预测基因在幼根和成熟叶片中表达量较高,而在幼芽和幼叶中表达量较低.这些预测基因的表达模式可能与它们的功能密切相关.
AP2/EREBP蛋白是廣汎存在于高等植物中的且包含AP2/EREBP 功能域的重要轉錄因子傢族,通常可分為包含單功能域的EREBP類蛋白和包含兩箇功能域的 AP2類蛋白,它們的功能涉及植物生長髮育調控和對逆境應答等許多方麵.據預測,水稻基因組編碼150箇左右的AP2/EREBP 傢族成員,但目前絕大多數蛋白的功能仍不清楚.為瞭解這些基因在水稻不同器官中的錶達特性,我們以AP2/EREBP功能域的氨基痠序列為基礎,從水稻基因組數據庫中搜索到12箇AP2類以及20箇EREBP類預測基因 ,利用PCR擴增的編碼區序列製備瞭這些預測基因的macro-array . 以幼芽、幼根、幼葉、穎花和灌漿期成熟葉的 cDNA為探針,雜交分析結果顯示: 不同AP2類預測基因之間的錶達量差彆較大,但同一箇基因在不同器官中錶達量基本一緻; 與此不同的是,大部分EREBP類預測基因在幼根和成熟葉片中錶達量較高,而在幼芽和幼葉中錶達量較低.這些預測基因的錶達模式可能與它們的功能密切相關.
AP2/EREBP단백시엄범존재우고등식물중적차포함AP2/EREBP 공능역적중요전록인자가족,통상가분위포함단공능역적EREBP류단백화포함량개공능역적 AP2류단백,타문적공능섭급식물생장발육조공화대역경응답등허다방면.거예측,수도기인조편마150개좌우적AP2/EREBP 가족성원,단목전절대다수단백적공능잉불청초.위료해저사기인재수도불동기관중적표체특성,아문이AP2/EREBP공능역적안기산서렬위기출,종수도기인조수거고중수색도12개AP2류이급20개EREBP류예측기인 ,이용PCR확증적편마구서렬제비료저사예측기인적macro-array . 이유아、유근、유협、영화화관장기성숙협적 cDNA위탐침,잡교분석결과현시: 불동AP2류예측기인지간적표체량차별교대,단동일개기인재불동기관중표체량기본일치; 여차불동적시,대부분EREBP류예측기인재유근화성숙협편중표체량교고,이재유아화유협중표체량교저.저사예측기인적표체모식가능여타문적공능밀절상관.
