高等学校化学学报
高等學校化學學報
고등학교화학학보
CHEMICAL JOURNAL OF CHINESE UNIVERSITIES
2010年
5期
938-946
,共9页
鲍红娟%唐亚林%徐筱杰%向俊锋%郑智慧%路新华
鮑紅娟%唐亞林%徐篠傑%嚮俊鋒%鄭智慧%路新華
포홍연%당아림%서소걸%향준봉%정지혜%로신화
DHODH 抑制剂%构效关系%药效团模型%虚拟筛选
DHODH 抑製劑%構效關繫%藥效糰模型%虛擬篩選
DHODH 억제제%구효관계%약효단모형%허의사선
利用药效团模型研究二氢乳清酸脱氢酶(Dihydroorotate dehydrogenase, DHODH)抑制剂的构效关系, 为DHODH抑制剂的虚拟筛选提供新的方法. 以31个具有DHODH抑制活性的化合物为训练集化合物, 半数抑制浓度(IC50)范围为7 ～63000 nmol/L, 利用Catalyst/HypoGen算法构建DHODH抑制剂药效团模型, 通过对训练集化合物多个构象进行叠合, 提取药效团特征及三维空间限制构建药效团模型. 利用基于CatScramble的交叉验证方法及评价模型对已知活性化合物的活性预测能力, 确定较优药效团模型. 模型包含1个氢键受体、 3个疏水中心, 表征了受体配体相互作用时可能发生的氢键相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用, 4个药效特征在三维空间的排列概括了DHODH抑制剂产生活性的结构特点. 所得较优模型对训练集化合物及测试集化合物的计算活性值与实验活性值的相关系数分别为0.8405和0.8788. 利用药效团模型对来源于微生物的系列化合物进行虚拟筛选, 筛选出59个预测活性较好的化合物, 可作为进一步药物研发的候选化合物.
利用藥效糰模型研究二氫乳清痠脫氫酶(Dihydroorotate dehydrogenase, DHODH)抑製劑的構效關繫, 為DHODH抑製劑的虛擬篩選提供新的方法. 以31箇具有DHODH抑製活性的化閤物為訓練集化閤物, 半數抑製濃度(IC50)範圍為7 ～63000 nmol/L, 利用Catalyst/HypoGen算法構建DHODH抑製劑藥效糰模型, 通過對訓練集化閤物多箇構象進行疊閤, 提取藥效糰特徵及三維空間限製構建藥效糰模型. 利用基于CatScramble的交扠驗證方法及評價模型對已知活性化閤物的活性預測能力, 確定較優藥效糰模型. 模型包含1箇氫鍵受體、 3箇疏水中心, 錶徵瞭受體配體相互作用時可能髮生的氫鍵相互作用、疏水相互作用和π-π相互作用, 4箇藥效特徵在三維空間的排列概括瞭DHODH抑製劑產生活性的結構特點. 所得較優模型對訓練集化閤物及測試集化閤物的計算活性值與實驗活性值的相關繫數分彆為0.8405和0.8788. 利用藥效糰模型對來源于微生物的繫列化閤物進行虛擬篩選, 篩選齣59箇預測活性較好的化閤物, 可作為進一步藥物研髮的候選化閤物.
이용약효단모형연구이경유청산탈경매(Dihydroorotate dehydrogenase, DHODH)억제제적구효관계, 위DHODH억제제적허의사선제공신적방법. 이31개구유DHODH억제활성적화합물위훈련집화합물, 반수억제농도(IC50)범위위7 ～63000 nmol/L, 이용Catalyst/HypoGen산법구건DHODH억제제약효단모형, 통과대훈련집화합물다개구상진행첩합, 제취약효단특정급삼유공간한제구건약효단모형. 이용기우CatScramble적교차험증방법급평개모형대이지활성화합물적활성예측능력, 학정교우약효단모형. 모형포함1개경건수체、 3개소수중심, 표정료수체배체상호작용시가능발생적경건상호작용、소수상호작용화π-π상호작용, 4개약효특정재삼유공간적배렬개괄료DHODH억제제산생활성적결구특점. 소득교우모형대훈련집화합물급측시집화합물적계산활성치여실험활성치적상관계수분별위0.8405화0.8788. 이용약효단모형대래원우미생물적계렬화합물진행허의사선, 사선출59개예측활성교호적화합물, 가작위진일보약물연발적후선화합물.
