上海交通大学学报（农业科学版）
上海交通大學學報（農業科學版）
상해교통대학학보（농업과학판）
JOURNAL OF SHANGHAI JIAOTONG UNIVERSITY(AGRICULTURAL SCIENCE)
2012年
1期
65-71
,共7页
黑灵芝%真菌免疫调节蛋白%基因克隆%生物信息学分析
黑靈芝%真菌免疫調節蛋白%基因剋隆%生物信息學分析
흑령지%진균면역조절단백%기인극륭%생물신식학분석
黑灵芝(Ganoderma astum)是灵芝家族中一个重要成员,克隆和分析黑灵芝免疫调节蛋白基因,可为进一步了解真菌免疫调节蛋白在种群中的分布打下基础.以黑灵芝为材料,采用同源克隆方法,对真菌免疫调节蛋白(FIPs)基因进行PCR扩增,并对其核苷酸编码序列进行了生物信息学分析.结果表明:黑灵芝真菌免疫调节蛋白基因序列包含336 bp,可编码111个氨基酸残基,命名为FIP-gas.FIP-gas分子量为12.4 kD,理论等电点为4.80,符合FIPs的特性,是FIPs家族一新成员.对FIP-gas进行序列分析发现其氨基酸序列具有FIPs的保守序列模式,与紫灵芝(G.japoncium)、紫芝(G.sinensis)、小孢灵芝(G.microsporum)、赤灵芝(G.lucidum)、松杉灵芝(G.tsugae)、金针菇(Flammulina veluti pes)及草菇(Volvariella volvacea)的FIP序列的同源性分别为99％、98％、87％、86％、86％、61％、55％.系统进化树分析表明黑灵芝的FIP与紫芝的FIP亲缘性最高,与金针菇和草菇的FIP亲缘性相对较远.该研究为进一步了解免疫调节蛋白在灵芝种群中的分布提供了较详细的数据.
黑靈芝(Ganoderma astum)是靈芝傢族中一箇重要成員,剋隆和分析黑靈芝免疫調節蛋白基因,可為進一步瞭解真菌免疫調節蛋白在種群中的分佈打下基礎.以黑靈芝為材料,採用同源剋隆方法,對真菌免疫調節蛋白(FIPs)基因進行PCR擴增,併對其覈苷痠編碼序列進行瞭生物信息學分析.結果錶明:黑靈芝真菌免疫調節蛋白基因序列包含336 bp,可編碼111箇氨基痠殘基,命名為FIP-gas.FIP-gas分子量為12.4 kD,理論等電點為4.80,符閤FIPs的特性,是FIPs傢族一新成員.對FIP-gas進行序列分析髮現其氨基痠序列具有FIPs的保守序列模式,與紫靈芝(G.japoncium)、紫芝(G.sinensis)、小孢靈芝(G.microsporum)、赤靈芝(G.lucidum)、鬆杉靈芝(G.tsugae)、金針菇(Flammulina veluti pes)及草菇(Volvariella volvacea)的FIP序列的同源性分彆為99％、98％、87％、86％、86％、61％、55％.繫統進化樹分析錶明黑靈芝的FIP與紫芝的FIP親緣性最高,與金針菇和草菇的FIP親緣性相對較遠.該研究為進一步瞭解免疫調節蛋白在靈芝種群中的分佈提供瞭較詳細的數據.
흑령지(Ganoderma astum)시령지가족중일개중요성원,극륭화분석흑령지면역조절단백기인,가위진일보료해진균면역조절단백재충군중적분포타하기출.이흑령지위재료,채용동원극륭방법,대진균면역조절단백(FIPs)기인진행PCR확증,병대기핵감산편마서렬진행료생물신식학분석.결과표명:흑령지진균면역조절단백기인서렬포함336 bp,가편마111개안기산잔기,명명위FIP-gas.FIP-gas분자량위12.4 kD,이론등전점위4.80,부합FIPs적특성,시FIPs가족일신성원.대FIP-gas진행서렬분석발현기안기산서렬구유FIPs적보수서렬모식,여자령지(G.japoncium)、자지(G.sinensis)、소포령지(G.microsporum)、적령지(G.lucidum)、송삼령지(G.tsugae)、금침고(Flammulina veluti pes)급초고(Volvariella volvacea)적FIP서렬적동원성분별위99％、98％、87％、86％、86％、61％、55％.계통진화수분석표명흑령지적FIP여자지적FIP친연성최고,여금침고화초고적FIP친연성상대교원.해연구위진일보료해면역조절단백재령지충군중적분포제공료교상세적수거.
