CAJ | 학술논문

针对56个环氧酮肽衍生物,分别采用比较分子场分析(comparative molecular field analysis,CoMFA)、比较分子相似性形状指数分析(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)、Topomer CoMFA、Hologram QSAR(HQSAR)以及基于一维和二维描述符的支持向量机(support vector machine,SVM)方法进行了细致的构效关系研究.研究显示:通过引入一维和二维描述符的SVM建模方法,避免了柔性分子在三维构效关系研究中的构象选择和叠合难题,亦可有效避免过拟合现象的发生.所建最优SVM模型的决定系数R2、均方根误差(RMS)、交互验证系数Q2和外部预测R2pred分别为0.681,0.436,0.572和0.641.分析结果显示:电性、拓扑特征、疏水性和分子体积是影响环氧酮肽蛋白酶体抑制活性的主要因素.在此基础上,以活性最高样本分子(CID:42638286的)为模板,基于相似性评价方法对其侧链进行设计,结合Lipinski“5规则”类药性筛选,共得到12个新颖目标分子,且预测活性均达到纳摩尔水平.
침대56개배양동태연생물,분별채용비교분자장분석(comparative molecular field analysis,CoMFA)、비교분자상사성형상지수분석(comparative molecular similarity indices analysis,CoMSIA)、Topomer CoMFA、Hologram QSAR(HQSAR)이급기우일유화이유묘술부적지지향량궤(support vector machine,SVM)방법진행료세치적구효관계연구.연구현시:통과인입일유화이유묘술부적SVM건모방법,피면료유성분자재삼유구효관계연구중적구상선택화첩합난제,역가유효피면과의합현상적발생.소건최우SVM모형적결정계수R2、균방근오차(RMS)、교호험증계수Q2화외부예측R2pred분별위0.681,0.436,0.572화0.641.분석결과현시:전성、탁복특정、소수성화분자체적시영향배양동태단백매체억제활성적주요인소.재차기출상,이활성최고양본분자(CID:42638286적)위모판,기우상사성평개방법대기측련진행설계,결합Lipinski“5규칙”류약성사선,공득도12개신영목표분자,차예측활성균체도납마이수평.