湖南师范大学自然科学学报
湖南師範大學自然科學學報
호남사범대학자연과학학보
ACTA SCIENTIARUM NATURALIUM UNIVERSITATIS NORMALIS HUNANENSIS
2007年
4期
110-113
,共4页
刘元东%刘楚干%丁建南%邱冠周
劉元東%劉楚榦%丁建南%邱冠週
류원동%류초간%정건남%구관주
超氧化物歧化酶%腾冲嗜热厌氧菌%同源建模%进化踪迹分析%分子动力学
超氧化物歧化酶%騰遲嗜熱厭氧菌%同源建模%進化蹤跡分析%分子動力學
초양화물기화매%등충기열염양균%동원건모%진화종적분석%분자동역학
通过同源模建和分子动力学模拟,一个由腾冲嗜热厌氧菌的sod基因编码的蛋白质的可靠的分子结构被建立.对建立的结构进行进化踪迹分析识别出了11个踪迹残基.在它们当中,残基Asn36,Gly101和Glu158的位置遍布整个结构,无规可循;其余的残基都明显地聚于一个靠近铁原子的子类当中.这些结果表明,该基因编码含铁的超氧化物歧化酶;同时,那些铁原子附近的踪迹残基跟铁的绑定和催化功能直接相关.
通過同源模建和分子動力學模擬,一箇由騰遲嗜熱厭氧菌的sod基因編碼的蛋白質的可靠的分子結構被建立.對建立的結構進行進化蹤跡分析識彆齣瞭11箇蹤跡殘基.在它們噹中,殘基Asn36,Gly101和Glu158的位置遍佈整箇結構,無規可循;其餘的殘基都明顯地聚于一箇靠近鐵原子的子類噹中.這些結果錶明,該基因編碼含鐵的超氧化物歧化酶;同時,那些鐵原子附近的蹤跡殘基跟鐵的綁定和催化功能直接相關.
통과동원모건화분자동역학모의,일개유등충기열염양균적sod기인편마적단백질적가고적분자결구피건립.대건립적결구진행진화종적분석식별출료11개종적잔기.재타문당중,잔기Asn36,Gly101화Glu158적위치편포정개결구,무규가순;기여적잔기도명현지취우일개고근철원자적자류당중.저사결과표명,해기인편마함철적초양화물기화매;동시,나사철원자부근적종적잔기근철적방정화최화공능직접상관.
