渔业科学进展
漁業科學進展
어업과학진전
MARINE FISHERIES RESEARCH
2011年
2期
34-40
,共7页
棘头梅童鱼%群体遗传结构%线粒体控制区%序列
棘頭梅童魚%群體遺傳結構%線粒體控製區%序列
극두매동어%군체유전결구%선립체공제구%서렬
采用PCR扩增测序法获得了棘头梅童鱼Collichtys iucidus南通、启东、芦潮港、温州、瑞安、福州、番禺7个地理群体53尾鱼的mtDNA控制区全序列.棘头梅童鱼控制区序列长度为778~782 bp,序列长度变异主要是由位点的插入或缺失造成,识别了终止序列区TAS和保守序列区CSB1、CSB2、CSB3序列.共检测到多态位点66个,占全部序列的8.44%,检测到单倍型33种,平均单倍型多样性(Hd)为0.934 7±0.017 5,平均核苷酸多样性(π)为0.017 5±0.002 3.棘头梅童鱼群体内的遗传距离(K 2-P)为0.001 7~0.022 8,群体间的遗传距离为0.002 3~0.043 3,群体间的分化指数FsT为-0.058 4~0.845 8,基因流为0.05~19.62.AMOVA分析结果显示,群体间的变异为74.21%,群体内的变异为25.79%(P<0.05),表明群体间发生了显著的遗传分化.以NJ法构建的亲缘关系树显示,棘头梅童鱼7个群体分为两个大支,一支以北方类群(南通、启东、芦潮港、温州群体)个体为主,另一支以南方类群(福州和番禹群体)个体为主,而位于南、北方类群中间位置的瑞安群体则与两大类群均有交叉.
採用PCR擴增測序法穫得瞭棘頭梅童魚Collichtys iucidus南通、啟東、蘆潮港、溫州、瑞安、福州、番禺7箇地理群體53尾魚的mtDNA控製區全序列.棘頭梅童魚控製區序列長度為778~782 bp,序列長度變異主要是由位點的插入或缺失造成,識彆瞭終止序列區TAS和保守序列區CSB1、CSB2、CSB3序列.共檢測到多態位點66箇,佔全部序列的8.44%,檢測到單倍型33種,平均單倍型多樣性(Hd)為0.934 7±0.017 5,平均覈苷痠多樣性(π)為0.017 5±0.002 3.棘頭梅童魚群體內的遺傳距離(K 2-P)為0.001 7~0.022 8,群體間的遺傳距離為0.002 3~0.043 3,群體間的分化指數FsT為-0.058 4~0.845 8,基因流為0.05~19.62.AMOVA分析結果顯示,群體間的變異為74.21%,群體內的變異為25.79%(P<0.05),錶明群體間髮生瞭顯著的遺傳分化.以NJ法構建的親緣關繫樹顯示,棘頭梅童魚7箇群體分為兩箇大支,一支以北方類群(南通、啟東、蘆潮港、溫州群體)箇體為主,另一支以南方類群(福州和番禹群體)箇體為主,而位于南、北方類群中間位置的瑞安群體則與兩大類群均有交扠.
채용PCR확증측서법획득료극두매동어Collichtys iucidus남통、계동、호조항、온주、서안、복주、번우7개지리군체53미어적mtDNA공제구전서렬.극두매동어공제구서렬장도위778~782 bp,서렬장도변이주요시유위점적삽입혹결실조성,식별료종지서렬구TAS화보수서렬구CSB1、CSB2、CSB3서렬.공검측도다태위점66개,점전부서렬적8.44%,검측도단배형33충,평균단배형다양성(Hd)위0.934 7±0.017 5,평균핵감산다양성(π)위0.017 5±0.002 3.극두매동어군체내적유전거리(K 2-P)위0.001 7~0.022 8,군체간적유전거리위0.002 3~0.043 3,군체간적분화지수FsT위-0.058 4~0.845 8,기인류위0.05~19.62.AMOVA분석결과현시,군체간적변이위74.21%,군체내적변이위25.79%(P<0.05),표명군체간발생료현저적유전분화.이NJ법구건적친연관계수현시,극두매동어7개군체분위량개대지,일지이북방류군(남통、계동、호조항、온주군체)개체위주,령일지이남방류군(복주화번우군체)개체위주,이위우남、북방류군중간위치적서안군체칙여량대류군균유교차.