高分子学报
高分子學報
고분자학보
ACTA POLYMERICA SINICA
2004年
5期
688-692
,共5页
陈进%成军%姜舟婷%章林溪%赵得禄
陳進%成軍%薑舟婷%章林溪%趙得祿
진진%성군%강주정%장림계%조득록
(α/β)8桶状蛋白质,中程和远程紧密接触对,远程次序值,Fauchere-Pliska疏水性值
(α/β)8桶狀蛋白質,中程和遠程緊密接觸對,遠程次序值,Fauchere-Pliska疏水性值
(α/β)8통상단백질,중정화원정긴밀접촉대,원정차서치,Fauchere-Pliska소수성치
在计算蛋白质分子中的氨基酸紧密接触对时采用以氨基酸的重心代替Cα原子的新方法,通过计算(α/β)8桶状蛋白质中的中程和远程紧密接触对的数目,研究了不同氨基酸在形成紧密接触对时所具有的不同能力以及在蛋白质结构稳定性中所起的不同作用.发现在(α/β)8桶状蛋白质中氨基酸形成的远程紧密接触对数目与它的Fauchere-Pliska疏水性实验数值(FPH)存在着非常好的线性关系,而对于氨基酸所形成的中程紧密接触对数目不存在这种关系.同时还研究了(α/β)8桶状蛋白质分子大小,发现其回转半径大小与表示远程接触对数目的远程次序值LRO存在着关系.表明这一类(α/β)8桶状蛋白质具有相似的结构,分子的远程接触对数目越多,分子越紧密,分子尺寸就越小.同时还研究了不同氨基酸之间形成紧密接触对的能力.
在計算蛋白質分子中的氨基痠緊密接觸對時採用以氨基痠的重心代替Cα原子的新方法,通過計算(α/β)8桶狀蛋白質中的中程和遠程緊密接觸對的數目,研究瞭不同氨基痠在形成緊密接觸對時所具有的不同能力以及在蛋白質結構穩定性中所起的不同作用.髮現在(α/β)8桶狀蛋白質中氨基痠形成的遠程緊密接觸對數目與它的Fauchere-Pliska疏水性實驗數值(FPH)存在著非常好的線性關繫,而對于氨基痠所形成的中程緊密接觸對數目不存在這種關繫.同時還研究瞭(α/β)8桶狀蛋白質分子大小,髮現其迴轉半徑大小與錶示遠程接觸對數目的遠程次序值LRO存在著關繫.錶明這一類(α/β)8桶狀蛋白質具有相似的結構,分子的遠程接觸對數目越多,分子越緊密,分子呎吋就越小.同時還研究瞭不同氨基痠之間形成緊密接觸對的能力.
재계산단백질분자중적안기산긴밀접촉대시채용이안기산적중심대체Cα원자적신방법,통과계산(α/β)8통상단백질중적중정화원정긴밀접촉대적수목,연구료불동안기산재형성긴밀접촉대시소구유적불동능력이급재단백질결구은정성중소기적불동작용.발현재(α/β)8통상단백질중안기산형성적원정긴밀접촉대수목여타적Fauchere-Pliska소수성실험수치(FPH)존재착비상호적선성관계,이대우안기산소형성적중정긴밀접촉대수목불존재저충관계.동시환연구료(α/β)8통상단백질분자대소,발현기회전반경대소여표시원정접촉대수목적원정차서치LRO존재착관계.표명저일류(α/β)8통상단백질구유상사적결구,분자적원정접촉대수목월다,분자월긴밀,분자척촌취월소.동시환연구료불동안기산지간형성긴밀접촉대적능력.