计算机与应用化学
計算機與應用化學
계산궤여응용화학
COMPUTERS AND APPLIED CHEMISTRY
2012年
3期
376-382
,共7页
任晓婧%朱金玉%阎爱侠%胡小英
任曉婧%硃金玉%閻愛俠%鬍小英
임효청%주금옥%염애협%호소영
磺胺类药物%碳酸酐酶Ⅱ%Kohonen自组织神经网络%多元线性回归(MLR)%支持向量机(SVM)
磺胺類藥物%碳痠酐酶Ⅱ%Kohonen自組織神經網絡%多元線性迴歸(MLR)%支持嚮量機(SVM)
광알류약물%탄산항매Ⅱ%Kohonen자조직신경망락%다원선성회귀(MLR)%지지향량궤(SVM)
sulfonamide%human carbonic anhydrase Ⅱ%kohonen's self-organizing map (SOM)%multilinear regression (MLR)%support vector machine (SVM)
对125个磺胺类碳酸酐酶Ⅱ抑制剂的生物活性进行了预测研究.利用ADRIANA.Code软件计算得到了化合物的一系列2D和3D结构描述符,从中选用了12个描述符进行建模.分别用数学随机划分的方法和Kohonen自组织神经网络的方法把数据集划分成两组不同的训练集和测试集.对于这两组不同的训练集和测试集,分别利用多元线性回归(MLR)和支持向量机(SVM)的方法进行建模,共得到4个模型.其中SVM得到的2个模型,训练集的相关系数在0.92以上,测试集预测的相关系数都在0.90以上.所有模型可进一步用于碳酸酐酶Ⅱ抑制剂的虚拟筛选.
對125箇磺胺類碳痠酐酶Ⅱ抑製劑的生物活性進行瞭預測研究.利用ADRIANA.Code軟件計算得到瞭化閤物的一繫列2D和3D結構描述符,從中選用瞭12箇描述符進行建模.分彆用數學隨機劃分的方法和Kohonen自組織神經網絡的方法把數據集劃分成兩組不同的訓練集和測試集.對于這兩組不同的訓練集和測試集,分彆利用多元線性迴歸(MLR)和支持嚮量機(SVM)的方法進行建模,共得到4箇模型.其中SVM得到的2箇模型,訓練集的相關繫數在0.92以上,測試集預測的相關繫數都在0.90以上.所有模型可進一步用于碳痠酐酶Ⅱ抑製劑的虛擬篩選.
대125개광알류탄산항매Ⅱ억제제적생물활성진행료예측연구.이용ADRIANA.Code연건계산득도료화합물적일계렬2D화3D결구묘술부,종중선용료12개묘술부진행건모.분별용수학수궤화분적방법화Kohonen자조직신경망락적방법파수거집화분성량조불동적훈련집화측시집.대우저량조불동적훈련집화측시집,분별이용다원선성회귀(MLR)화지지향량궤(SVM)적방법진행건모,공득도4개모형.기중SVM득도적2개모형,훈련집적상관계수재0.92이상,측시집예측적상관계수도재0.90이상.소유모형가진일보용우탄산항매Ⅱ억제제적허의사선.
Several quantitative models for the prediction of inhibitory activity of the 125 sulfonamide inhibitors of human carbonic anhydrase Ⅱ (hCA Ⅱ) enzyme were developed.The molecules were represented by 12 selected 2D and 3D molecular descriptors calculated by the ADRIANA.Code.The whole dataset was split into a training set and a test set using two different methods:(1) by a random selection; and (2) on the basis ofa Kohonen's self-organizing map (SOM).Then the inhibitory activity of the sulfonamide inhibitors of hCA Ⅱ was predicted using a multilinear regression (MLR) analysis and a support vector machine (SVM).For the two SVM models,for the training sets,both the correlation coefficients of 0.92 were obtained; for the test sets,the correlation coefficients of over 0.90 were achieved.All models obtained in this study could be used to for further virtual screening research of inhibitors of human carbonic anhydrase Ⅱ.