林业科学
林業科學
임업과학
SCIENTIA SILVAE SINICAE
2009年
9期
53-59
,共7页
张新叶%宋丛文%张亚东%杨彦伶%黄敏仁
張新葉%宋叢文%張亞東%楊彥伶%黃敏仁
장신협%송총문%장아동%양언령%황민인
杨树%表达序列标签(EST)%简单重复序列(SSR)
楊樹%錶達序列標籤(EST)%簡單重複序列(SSR)
양수%표체서렬표첨(EST)%간단중복서렬(SSR)
利用来自美洲黑杨及欧美杨的20 023条EST序列,进行EST-SSR标记开发研究.首先对这些EST序列进行序列拼接,然后在非重复序列中发现由二核苷酸至五核苷酸组成的SSR重复序列.共在10 816个非重复序列中发现1 604个序列含有SSR,占总非重复序列的14.8%.在发现的1 918个SSR重复序列中,二核苷酸重复是最丰富的重复类型,占总类型的62.3%.设计合成48对SSR引物,利用6个不同的杨树品种对其进行验证.结果约90%的引物获得扩增产物,58%的引物在6个不同杨树品种中产生多态性分离.另外,还对重复序列的数量及重复类型进行了讨论.
利用來自美洲黑楊及歐美楊的20 023條EST序列,進行EST-SSR標記開髮研究.首先對這些EST序列進行序列拼接,然後在非重複序列中髮現由二覈苷痠至五覈苷痠組成的SSR重複序列.共在10 816箇非重複序列中髮現1 604箇序列含有SSR,佔總非重複序列的14.8%.在髮現的1 918箇SSR重複序列中,二覈苷痠重複是最豐富的重複類型,佔總類型的62.3%.設計閤成48對SSR引物,利用6箇不同的楊樹品種對其進行驗證.結果約90%的引物穫得擴增產物,58%的引物在6箇不同楊樹品種中產生多態性分離.另外,還對重複序列的數量及重複類型進行瞭討論.
이용래자미주흑양급구미양적20 023조EST서렬,진행EST-SSR표기개발연구.수선대저사EST서렬진행서렬병접,연후재비중복서렬중발현유이핵감산지오핵감산조성적SSR중복서렬.공재10 816개비중복서렬중발현1 604개서렬함유SSR,점총비중복서렬적14.8%.재발현적1 918개SSR중복서렬중,이핵감산중복시최봉부적중복류형,점총류형적62.3%.설계합성48대SSR인물,이용6개불동적양수품충대기진행험증.결과약90%적인물획득확증산물,58%적인물재6개불동양수품충중산생다태성분리.령외,환대중복서렬적수량급중복류형진행료토론.
