温州医学院学报
溫州醫學院學報
온주의학원학보
JOURNAL OF WENZHOU MEDICAL COLLEGE
2009年
6期
546-550
,共5页
登革病毒%测序%系统进化分析
登革病毒%測序%繫統進化分析
등혁병독%측서%계통진화분석
目的:对引起2002年广州登革热的登革1型病毒分离株(71/02GZ)进行全基因组测序和系统进化分析.方法:采用C6/36细胞培养71/02GZ,分别采用RT -PCR,5'RACE和3'RACE扩增基因组中编码区序列、5'和3 '末端非编码区序列,PCR产物克隆到载体并测序,拼接成全基因组序列,分别基于 E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016nt进行系统进化分析.结果:71/02GZ株基因组全长10735 nt,两端非编码区(NCR)长度分别为94 nt和462 nt.基于E基因序列、E/NS1连接区240 nt、基因组中10016 nt的进化分析结果显示71/02GZ株和2002年广州分离株(GZ01/02,GZ/218/2002),1995 年广东分离株(GD23/95,GD01/95)、1995年广州分离株(GZ01/95)组成一个基因型;而1999年广东分离株(GD05/99),1997年广东分离株(GD14/97)和1980年广州分离株(GZ/80)属于另一个基因型;另外,71/02GZ株同1998年印度尼西亚分离株(98901530 DF DV-1-ID)的同源性最高.结论:71/02GZ株可能是印度尼西亚输入的.
目的:對引起2002年廣州登革熱的登革1型病毒分離株(71/02GZ)進行全基因組測序和繫統進化分析.方法:採用C6/36細胞培養71/02GZ,分彆採用RT -PCR,5'RACE和3'RACE擴增基因組中編碼區序列、5'和3 '末耑非編碼區序列,PCR產物剋隆到載體併測序,拼接成全基因組序列,分彆基于 E基因序列、E/NS1連接區240 nt、基因組中10016nt進行繫統進化分析.結果:71/02GZ株基因組全長10735 nt,兩耑非編碼區(NCR)長度分彆為94 nt和462 nt.基于E基因序列、E/NS1連接區240 nt、基因組中10016 nt的進化分析結果顯示71/02GZ株和2002年廣州分離株(GZ01/02,GZ/218/2002),1995 年廣東分離株(GD23/95,GD01/95)、1995年廣州分離株(GZ01/95)組成一箇基因型;而1999年廣東分離株(GD05/99),1997年廣東分離株(GD14/97)和1980年廣州分離株(GZ/80)屬于另一箇基因型;另外,71/02GZ株同1998年印度尼西亞分離株(98901530 DF DV-1-ID)的同源性最高.結論:71/02GZ株可能是印度尼西亞輸入的.
목적:대인기2002년엄주등혁열적등혁1형병독분리주(71/02GZ)진행전기인조측서화계통진화분석.방법:채용C6/36세포배양71/02GZ,분별채용RT -PCR,5'RACE화3'RACE확증기인조중편마구서렬、5'화3 '말단비편마구서렬,PCR산물극륭도재체병측서,병접성전기인조서렬,분별기우 E기인서렬、E/NS1련접구240 nt、기인조중10016nt진행계통진화분석.결과:71/02GZ주기인조전장10735 nt,량단비편마구(NCR)장도분별위94 nt화462 nt.기우E기인서렬、E/NS1련접구240 nt、기인조중10016 nt적진화분석결과현시71/02GZ주화2002년엄주분리주(GZ01/02,GZ/218/2002),1995 년엄동분리주(GD23/95,GD01/95)、1995년엄주분리주(GZ01/95)조성일개기인형;이1999년엄동분리주(GD05/99),1997년엄동분리주(GD14/97)화1980년엄주분리주(GZ/80)속우령일개기인형;령외,71/02GZ주동1998년인도니서아분리주(98901530 DF DV-1-ID)적동원성최고.결론:71/02GZ주가능시인도니서아수입적.
