中山大学学报(医学科学版)
中山大學學報(醫學科學版)
중산대학학보(의학과학판)
JOURNAL OF SUN YAT-SEN UNIVERSITY(MEDICAL SCIENCES)
2007年
3期
348-352
,共5页
刘稳升%胡斐%吕志跃%郑焕钦%袁衡新%吴忠道
劉穩升%鬍斐%呂誌躍%鄭煥欽%袁衡新%吳忠道
류은승%호비%려지약%정환흠%원형신%오충도
日本血吸虫%基因组%序列分析系统
日本血吸蟲%基因組%序列分析繫統
일본혈흡충%기인조%서렬분석계통
[目的]构建基于基因组学的日本血吸虫序列分析平台.[方法]基于工作站和Linux操作系统,利用公开的日本血吸虫或相关资源,收集有关生物信息学序列分析工具,并自行编写相关软件实现多种资源的有机整合.[结果]构建了本地化的日本血吸虫序列分析平台,在此基础上,自主设计了日本血吸虫EST序列的电子延伸系统、基于日本血吸虫EST数据库的同源全长cDNA序列检索系统和序列自动注释系统等.[结论]所构建的序列分析平台不仅可以完成常规的序列分析工作,还可成功地完成EST序列的电子延伸,同源全长cDNA序列的检索以及序列的自动注释,它可对大规模日本血吸虫序列进行快速、方便、高效的分析,为充分利用血吸虫基因组开展疫苗研究和新药开发提供了有效的技术手段.
[目的]構建基于基因組學的日本血吸蟲序列分析平檯.[方法]基于工作站和Linux操作繫統,利用公開的日本血吸蟲或相關資源,收集有關生物信息學序列分析工具,併自行編寫相關軟件實現多種資源的有機整閤.[結果]構建瞭本地化的日本血吸蟲序列分析平檯,在此基礎上,自主設計瞭日本血吸蟲EST序列的電子延伸繫統、基于日本血吸蟲EST數據庫的同源全長cDNA序列檢索繫統和序列自動註釋繫統等.[結論]所構建的序列分析平檯不僅可以完成常規的序列分析工作,還可成功地完成EST序列的電子延伸,同源全長cDNA序列的檢索以及序列的自動註釋,它可對大規模日本血吸蟲序列進行快速、方便、高效的分析,為充分利用血吸蟲基因組開展疫苗研究和新藥開髮提供瞭有效的技術手段.
[목적]구건기우기인조학적일본혈흡충서렬분석평태.[방법]기우공작참화Linux조작계통,이용공개적일본혈흡충혹상관자원,수집유관생물신식학서렬분석공구,병자행편사상관연건실현다충자원적유궤정합.[결과]구건료본지화적일본혈흡충서렬분석평태,재차기출상,자주설계료일본혈흡충EST서렬적전자연신계통、기우일본혈흡충EST수거고적동원전장cDNA서렬검색계통화서렬자동주석계통등.[결론]소구건적서렬분석평태불부가이완성상규적서렬분석공작,환가성공지완성EST서렬적전자연신,동원전장cDNA서렬적검색이급서렬적자동주석,타가대대규모일본혈흡충서렬진행쾌속、방편、고효적분석,위충분이용혈흡충기인조개전역묘연구화신약개발제공료유효적기술수단.