临床肺科杂志
臨床肺科雜誌
림상폐과잡지
JOUNAL OF CLINICAL PULMONARY MEDICINE
2010年
7期
957-961
,共5页
郑晓静%郑素华%杜博平%贾红彦%李卫民%丁北川%王甦民%张宗德
鄭曉靜%鄭素華%杜博平%賈紅彥%李衛民%丁北川%王甦民%張宗德
정효정%정소화%두박평%가홍언%리위민%정북천%왕소민%장종덕
结核分枝杆菌%北京家族%限制性片段长度多态性%间隔区寡核苷酸分型%可变数量串联重复序列
結覈分枝桿菌%北京傢族%限製性片段長度多態性%間隔區寡覈苷痠分型%可變數量串聯重複序列
결핵분지간균%북경가족%한제성편단장도다태성%간격구과핵감산분형%가변수량천련중복서렬
目的 对于北京家族菌株占绝大多数的感染人群,评价多位点可变数量串联重复序列(variable number tandem repeats,VNTR)分析(multiple loci VNTR analysis,MLVA)中不同位点组合在结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)基因分型研究中的应用.并以IS6110限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)为参照,筛选有效位点.方法 分别采用IS6110-RFLP、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及MLVA不同位点组合对北京海淀区收集的MTB临床分离株进行基因分型研究,比较3种方法及MLVA不同位点组合的分型效果.结果 45株MTB分离株中86.7%为北京家族菌株,Spoligotyping和结核分枝杆菌散在分布重复单位(mycobacterial interpersed repetitive units,MIRU)-12系列的HGI(Hunter-Gaston Index)值分别为0.4313和0.8700,将45株MTB菌株分为10个和23个基因型.VNTR-9系列和IS6110-RFLP的分型结果一致,HGI值较高,为0.9980,将45株MTB菌株分为43个基因型.结论 北京家族结核分枝杆菌在北京海淀区呈高水平流行.对于北京地区北京家族菌株占绝大多数的感染人群,VNTR-9系列MLVA是较为简便和高分辨率的分型方法,其分辨率能够达到MTB基因分型"金标准"IS6110-RFLP水平.
目的 對于北京傢族菌株佔絕大多數的感染人群,評價多位點可變數量串聯重複序列(variable number tandem repeats,VNTR)分析(multiple loci VNTR analysis,MLVA)中不同位點組閤在結覈分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)基因分型研究中的應用.併以IS6110限製性片段長度多態性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)為參照,篩選有效位點.方法 分彆採用IS6110-RFLP、間隔區寡覈苷痠分型(Spoligotyping)及MLVA不同位點組閤對北京海澱區收集的MTB臨床分離株進行基因分型研究,比較3種方法及MLVA不同位點組閤的分型效果.結果 45株MTB分離株中86.7%為北京傢族菌株,Spoligotyping和結覈分枝桿菌散在分佈重複單位(mycobacterial interpersed repetitive units,MIRU)-12繫列的HGI(Hunter-Gaston Index)值分彆為0.4313和0.8700,將45株MTB菌株分為10箇和23箇基因型.VNTR-9繫列和IS6110-RFLP的分型結果一緻,HGI值較高,為0.9980,將45株MTB菌株分為43箇基因型.結論 北京傢族結覈分枝桿菌在北京海澱區呈高水平流行.對于北京地區北京傢族菌株佔絕大多數的感染人群,VNTR-9繫列MLVA是較為簡便和高分辨率的分型方法,其分辨率能夠達到MTB基因分型"金標準"IS6110-RFLP水平.
목적 대우북경가족균주점절대다수적감염인군,평개다위점가변수량천련중복서렬(variable number tandem repeats,VNTR)분석(multiple loci VNTR analysis,MLVA)중불동위점조합재결핵분지간균(Mycobacterium tuberculosis,MTB)기인분형연구중적응용.병이IS6110한제성편단장도다태성(restriction fragment length polymorphism,RFLP)위삼조,사선유효위점.방법 분별채용IS6110-RFLP、간격구과핵감산분형(Spoligotyping)급MLVA불동위점조합대북경해정구수집적MTB림상분리주진행기인분형연구,비교3충방법급MLVA불동위점조합적분형효과.결과 45주MTB분리주중86.7%위북경가족균주,Spoligotyping화결핵분지간균산재분포중복단위(mycobacterial interpersed repetitive units,MIRU)-12계렬적HGI(Hunter-Gaston Index)치분별위0.4313화0.8700,장45주MTB균주분위10개화23개기인형.VNTR-9계렬화IS6110-RFLP적분형결과일치,HGI치교고,위0.9980,장45주MTB균주분위43개기인형.결론 북경가족결핵분지간균재북경해정구정고수평류행.대우북경지구북경가족균주점절대다수적감염인군,VNTR-9계렬MLVA시교위간편화고분변솔적분형방법,기분변솔능구체도MTB기인분형"금표준"IS6110-RFLP수평.
