临床内科杂志
臨床內科雜誌
림상내과잡지
JOURNAL OF CLINICAL INTERNAL MEDICINE
2011年
9期
631-633
,共3页
朱永豹%黄元成%田德英%刘丹
硃永豹%黃元成%田德英%劉丹
주영표%황원성%전덕영%류단
戊型肝炎病毒%开放读码框3%基因变异
戊型肝炎病毒%開放讀碼框3%基因變異
무형간염병독%개방독마광3%기인변이
目的 检测并分析武汉地区基因Ⅳ型戊型肝炎(HEV)病毒开放读码框3 (ORF3)基因变异情况.方法 采用逆转录-巢式聚合酶链反应(RT-nPCR)扩增41株基因Ⅳ型HEV RNA两个基因片段(nt5020～nt5392和nt5347～nt5956;参考病毒株:EF570133),并对PCR产物进行测序,然后使用ContigExpress将测序结果拼接(含有HEV ORF3全序列),使用MegAlign (DNA Star软件包)对ORF3进行比对,查看ORF3基因及其编码蛋白变异情况.结果 41株基因Ⅳ型REV RNA两个基因片段均扩增出来的毒株为18株,18株HEV ORF3检测出47个位点存在核苷酸替换,其中21个替换发生在密码子第1、2位核苷酸,26个替换发生在密码子第3位核苷酸;其编码蛋白存在19个位点氨基酸变异.结论 武汉地区基因Ⅳ型HEV ORF3存在多个位点核苷酸替换,这些位点变异在急性戊型肝炎病情进展中有何意义,有待于进一步研究.
目的 檢測併分析武漢地區基因Ⅳ型戊型肝炎(HEV)病毒開放讀碼框3 (ORF3)基因變異情況.方法 採用逆轉錄-巢式聚閤酶鏈反應(RT-nPCR)擴增41株基因Ⅳ型HEV RNA兩箇基因片段(nt5020～nt5392和nt5347～nt5956;參攷病毒株:EF570133),併對PCR產物進行測序,然後使用ContigExpress將測序結果拼接(含有HEV ORF3全序列),使用MegAlign (DNA Star軟件包)對ORF3進行比對,查看ORF3基因及其編碼蛋白變異情況.結果 41株基因Ⅳ型REV RNA兩箇基因片段均擴增齣來的毒株為18株,18株HEV ORF3檢測齣47箇位點存在覈苷痠替換,其中21箇替換髮生在密碼子第1、2位覈苷痠,26箇替換髮生在密碼子第3位覈苷痠;其編碼蛋白存在19箇位點氨基痠變異.結論 武漢地區基因Ⅳ型HEV ORF3存在多箇位點覈苷痠替換,這些位點變異在急性戊型肝炎病情進展中有何意義,有待于進一步研究.
목적 검측병분석무한지구기인Ⅳ형무형간염(HEV)병독개방독마광3 (ORF3)기인변이정황.방법 채용역전록-소식취합매련반응(RT-nPCR)확증41주기인Ⅳ형HEV RNA량개기인편단(nt5020～nt5392화nt5347～nt5956;삼고병독주:EF570133),병대PCR산물진행측서,연후사용ContigExpress장측서결과병접(함유HEV ORF3전서렬),사용MegAlign (DNA Star연건포)대ORF3진행비대,사간ORF3기인급기편마단백변이정황.결과 41주기인Ⅳ형REV RNA량개기인편단균확증출래적독주위18주,18주HEV ORF3검측출47개위점존재핵감산체환,기중21개체환발생재밀마자제1、2위핵감산,26개체환발생재밀마자제3위핵감산;기편마단백존재19개위점안기산변이.결론 무한지구기인Ⅳ형HEV ORF3존재다개위점핵감산체환,저사위점변이재급성무형간염병정진전중유하의의,유대우진일보연구.
