中国病理生理杂志
中國病理生理雜誌
중국병리생리잡지
CHINESE JOURNAL OF PATHOPHYSIOLOGY
2011年
11期
2140-2146
,共7页
张斌%肖林%肖文娟%刘泽寰
張斌%肖林%肖文娟%劉澤寰
장빈%초림%초문연%류택환
Toll样受体1%单核苷酸多态性%插入/缺失%广东汉族人群
Toll樣受體1%單覈苷痠多態性%插入/缺失%廣東漢族人群
Toll양수체1%단핵감산다태성%삽입/결실%엄동한족인군
目的:人类Toll样受体1(TLR1)在先天性免疫中起着重要作用.本文将着重研究广东地区汉族正常人群中TLR1基因功能区的单核苷酸多态性(SNPs)图谱和频率分布.方法:随机收集50例健康、无亲缘关系的中国广东地区汉族人外周血液,对TLR1基因的启动子区、5和3非翻译区、4个外显子区的序列进行PCR扩增和直接测序,找出多态性位点及其频率分布规律.在此基础上对多态性位点进行Hardy-Weinberg平衡分析、中性进化分析和连锁不平衡分析.结果:共发现17个SNPs以及2个插入/缺失多态位点,其中2个是首次发现的新多态性位点.位于编码区的新SNP位点+1 378 A/G为非同义突变位点,能导致460位丝氨酸(Ser)残基替换为甘氨酸(Gly)残基,并且这个氨基酸残基的替换处于TLR1胞外区的LRR结构域中,从而有可能影响蛋白的识别功能.另外,频率最高的SNPs是+743 A/G和+1 518 A/G,其次要等位基因频率均达到48%.所有多态性位点均符合Hardy-Weinberg平衡.中性检验显示广东汉族人群TLR1基因不符合中性进化假说,很可能是其调控区受到平衡选择作用的原因.连锁不平衡分析显示多态性位点-6 912 C/TA、-6 876 C/T、-6 399 C/T和-6 375 C/T之间,-6 847 A/G和-6 737 A/T之间,以及-5 984 -/CT、-5 531 A/G和-5 490 C/G之间完全连锁.结论:本研究首次报道了汉族正常人群TLR1基因的功能性多态性图谱,发现了一些种族特异性的多态性位点及频率分布规律,为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究打下一定的基础.
目的:人類Toll樣受體1(TLR1)在先天性免疫中起著重要作用.本文將著重研究廣東地區漢族正常人群中TLR1基因功能區的單覈苷痠多態性(SNPs)圖譜和頻率分佈.方法:隨機收集50例健康、無親緣關繫的中國廣東地區漢族人外週血液,對TLR1基因的啟動子區、5和3非翻譯區、4箇外顯子區的序列進行PCR擴增和直接測序,找齣多態性位點及其頻率分佈規律.在此基礎上對多態性位點進行Hardy-Weinberg平衡分析、中性進化分析和連鎖不平衡分析.結果:共髮現17箇SNPs以及2箇插入/缺失多態位點,其中2箇是首次髮現的新多態性位點.位于編碼區的新SNP位點+1 378 A/G為非同義突變位點,能導緻460位絲氨痠(Ser)殘基替換為甘氨痠(Gly)殘基,併且這箇氨基痠殘基的替換處于TLR1胞外區的LRR結構域中,從而有可能影響蛋白的識彆功能.另外,頻率最高的SNPs是+743 A/G和+1 518 A/G,其次要等位基因頻率均達到48%.所有多態性位點均符閤Hardy-Weinberg平衡.中性檢驗顯示廣東漢族人群TLR1基因不符閤中性進化假說,很可能是其調控區受到平衡選擇作用的原因.連鎖不平衡分析顯示多態性位點-6 912 C/TA、-6 876 C/T、-6 399 C/T和-6 375 C/T之間,-6 847 A/G和-6 737 A/T之間,以及-5 984 -/CT、-5 531 A/G和-5 490 C/G之間完全連鎖.結論:本研究首次報道瞭漢族正常人群TLR1基因的功能性多態性圖譜,髮現瞭一些種族特異性的多態性位點及頻率分佈規律,為今後開展漢族人基因多態性與疾病相關性研究打下一定的基礎.
목적:인류Toll양수체1(TLR1)재선천성면역중기착중요작용.본문장착중연구엄동지구한족정상인군중TLR1기인공능구적단핵감산다태성(SNPs)도보화빈솔분포.방법:수궤수집50례건강、무친연관계적중국엄동지구한족인외주혈액,대TLR1기인적계동자구、5화3비번역구、4개외현자구적서렬진행PCR확증화직접측서,조출다태성위점급기빈솔분포규률.재차기출상대다태성위점진행Hardy-Weinberg평형분석、중성진화분석화련쇄불평형분석.결과:공발현17개SNPs이급2개삽입/결실다태위점,기중2개시수차발현적신다태성위점.위우편마구적신SNP위점+1 378 A/G위비동의돌변위점,능도치460위사안산(Ser)잔기체환위감안산(Gly)잔기,병차저개안기산잔기적체환처우TLR1포외구적LRR결구역중,종이유가능영향단백적식별공능.령외,빈솔최고적SNPs시+743 A/G화+1 518 A/G,기차요등위기인빈솔균체도48%.소유다태성위점균부합Hardy-Weinberg평형.중성검험현시엄동한족인군TLR1기인불부합중성진화가설,흔가능시기조공구수도평형선택작용적원인.련쇄불평형분석현시다태성위점-6 912 C/TA、-6 876 C/T、-6 399 C/T화-6 375 C/T지간,-6 847 A/G화-6 737 A/T지간,이급-5 984 -/CT、-5 531 A/G화-5 490 C/G지간완전련쇄.결론:본연구수차보도료한족정상인군TLR1기인적공능성다태성도보,발현료일사충족특이성적다태성위점급빈솔분포규률,위금후개전한족인기인다태성여질병상관성연구타하일정적기출.