中国水产科学
中國水產科學
중국수산과학
Journal of Fishery Sciences of China
2008年
5期
755-765
,共11页
海参%16SrDNA%系统发生
海參%16SrDNA%繫統髮生
해삼%16SrDNA%계통발생
运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序.获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离.结果发现,10种海参富含AT碱基,A+T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007～0.316之间.所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系.结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近.对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于剌参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Hothuria edulis)关系最近.这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据.
運用PCR擴增10種海參的16SrDNA部分序列,併測序.穫得大小為566bp的序列,利用DNAsp4.0軟件分析比較10種海參的堿基組成、各堿基變異位點數、插入或缺失位點數,併採用MEGA4.0軟件分析彼此間的遺傳距離.結果髮現,10種海參富含AT堿基,A+T的含量平均為57.0%,不同種海參間髮生堿基轉換、顛換及髮生插入或缺失變異的位點數差異很大,10種海參彼此間的遺傳距離在0.007～0.316之間.所得結果與GenBank中10種海參的相應序列進行比對分析,同時用MEGA4.0和PAUP4.0軟件構建進化樹,分析其親緣關繫.結果錶明,利用16SrDNA序列的差異可以將分屬于海參科(Holothuriidae)與刺參科(Stichopodidae)的海參完全分開,瓜參科(Cucumariidae)的2箇種與刺參科的親緣關繫較近.對不同海參種間親緣關繫的分析結果還錶明,同屬于剌參科的倣刺參(Apostichopus japonicus)與加州擬刺參(Parastichopus californicus)和具疣擬刺參(Parastichopus parvimensis)親緣關繫最近,同屬于海參科的格皮氏海參(Pearsonothuria graeffei)與白尼參屬的蛇目白尼參(Bohadschia argus)和圖紋白尼參(B.marmorata)親緣關繫最近,而同樣為海參科的墨西哥海參(Holothuria mexicana)則與紅腹海參(Hothuria edulis)關繫最近.這些資料為海參的種質資源管理、新種引進和種質改良提供瞭基礎的分子生物學依據.
운용PCR확증10충해삼적16SrDNA부분서렬,병측서.획득대소위566bp적서렬,이용DNAsp4.0연건분석비교10충해삼적감기조성、각감기변이위점수、삽입혹결실위점수,병채용MEGA4.0연건분석피차간적유전거리.결과발현,10충해삼부함AT감기,A+T적함량평균위57.0%,불동충해삼간발생감기전환、전환급발생삽입혹결실변이적위점수차이흔대,10충해삼피차간적유전거리재0.007～0.316지간.소득결과여GenBank중10충해삼적상응서렬진행비대분석,동시용MEGA4.0화PAUP4.0연건구건진화수,분석기친연관계.결과표명,이용16SrDNA서렬적차이가이장분속우해삼과(Holothuriidae)여자삼과(Stichopodidae)적해삼완전분개,과삼과(Cucumariidae)적2개충여자삼과적친연관계교근.대불동해삼충간친연관계적분석결과환표명,동속우랄삼과적방자삼(Apostichopus japonicus)여가주의자삼(Parastichopus californicus)화구우의자삼(Parastichopus parvimensis)친연관계최근,동속우해삼과적격피씨해삼(Pearsonothuria graeffei)여백니삼속적사목백니삼(Bohadschia argus)화도문백니삼(B.marmorata)친연관계최근,이동양위해삼과적묵서가해삼(Holothuria mexicana)칙여홍복해삼(Hothuria edulis)관계최근.저사자료위해삼적충질자원관리、신충인진화충질개량제공료기출적분자생물학의거.
