清华大学学报（自然科学版）
清華大學學報（自然科學版）
청화대학학보（자연과학판）
JOURNAL OF TSINGHUA UNIVERSITY SCIENCE AND TECHNOLOGY
2006年
10期
1793-1796
,共4页
神经网络%RNA二级结构预测%SCFG模型
神經網絡%RNA二級結構預測%SCFG模型
신경망락%RNA이급결구예측%SCFG모형
针对利用经典的随机上下文无关文法(SCFG)等模型对RNA(Ribonucleic acid)二级结构进行预测时,存在计算复杂性问题,该文给出了RNA二级结构的"新二级结构单元标签"(NSSEL)表示,相应提出了一种新的RNA二级结构预测的神经网络方法.这种二级结构的NSSEL表示格式很容易转换成常用的CT格式.基于tRNA数据集的实验表明,在完全相同的训练与测试数据集下,该方法,较之性能最好的BJK与BK2等SCFG模型,其预测精度与相关系数都有所提高,证明了所提方法的可行性与有效性.由于神经网络启发式方法不存在计算时间复杂性问题,因此可望将此法用于预测SCFG等算法难以处理的大于1 000个碱基的长RNA序列的折叠问题.
針對利用經典的隨機上下文無關文法(SCFG)等模型對RNA(Ribonucleic acid)二級結構進行預測時,存在計算複雜性問題,該文給齣瞭RNA二級結構的"新二級結構單元標籤"(NSSEL)錶示,相應提齣瞭一種新的RNA二級結構預測的神經網絡方法.這種二級結構的NSSEL錶示格式很容易轉換成常用的CT格式.基于tRNA數據集的實驗錶明,在完全相同的訓練與測試數據集下,該方法,較之性能最好的BJK與BK2等SCFG模型,其預測精度與相關繫數都有所提高,證明瞭所提方法的可行性與有效性.由于神經網絡啟髮式方法不存在計算時間複雜性問題,因此可望將此法用于預測SCFG等算法難以處理的大于1 000箇堿基的長RNA序列的摺疊問題.
침대이용경전적수궤상하문무관문법(SCFG)등모형대RNA(Ribonucleic acid)이급결구진행예측시,존재계산복잡성문제,해문급출료RNA이급결구적"신이급결구단원표첨"(NSSEL)표시,상응제출료일충신적RNA이급결구예측적신경망락방법.저충이급결구적NSSEL표시격식흔용역전환성상용적CT격식.기우tRNA수거집적실험표명,재완전상동적훈련여측시수거집하,해방법,교지성능최호적BJK여BK2등SCFG모형,기예측정도여상관계수도유소제고,증명료소제방법적가행성여유효성.유우신경망락계발식방법불존재계산시간복잡성문제,인차가망장차법용우예측SCFG등산법난이처리적대우1 000개감기적장RNA서렬적절첩문제.
