河南农业大学学报
河南農業大學學報
하남농업대학학보
ACTA AGRICULTURAE UNIVERSITATIS HENANENSIS
2007年
6期
641-646
,共6页
安世恒%尹新明%江志伟%胡鹏%郭征%杨永青
安世恆%尹新明%江誌偉%鬍鵬%郭徵%楊永青
안세항%윤신명%강지위%호붕%곽정%양영청
家蚕%核型多角体病毒%ORF 75基因%生物信息学分析
傢蠶%覈型多角體病毒%ORF 75基因%生物信息學分析
가잠%핵형다각체병독%ORF 75기인%생물신식학분석
通过对家蚕核型多角体病毒(Bombyx mori,nucleopolyhedrovirus: BmNPV)ORF 75基因核苷酸序列进行生物信息学分析,BmNPV ORF 75基因位于病毒基因组70 485 bp和71 264 bp之间,编码259个氨基酸残基的多肽,预测分子相对质量为30.8 kDa,等电点为7.67,分子式为C1409H2157N351O390S19;蛋白在大肠杆菌内的半衰期大于10 h;酸性氨基酸(Asp + Glu)占10.5%,碱性氨基酸(Arg + Lys)占10.8%;蛋白的不稳定指数为42.67,是不稳定蛋白.利用Prosite数据库扫描,查到4类9个蛋白修饰位点.通过Blast搜索氨基酸同源序列发现,BmNPV ORF 75同源蛋白存在于所有测序的鳞翅目昆虫杆状病毒中,不存在于其他非鳞翅目昆虫杆状病毒中.同源序列比对结果,BmNPV ORF 75蛋白的氨基酸序列与苜蓿银纹夜蛾核型多角体病毒(Autographa californica MNPV) ORF 92之间的同源性达到100%,应为相同基因.依照BmNPV ORF 75同源基因序列相似性,对13种昆虫杆状病毒进行进化树构建分析,其中,BmNPV ORF 75与薄荷灰夜蛾多粒包埋型核型多角体病毒(Rachiplusia ou MNPV) ORF 89基因进化距离很近,同源性较高.
通過對傢蠶覈型多角體病毒(Bombyx mori,nucleopolyhedrovirus: BmNPV)ORF 75基因覈苷痠序列進行生物信息學分析,BmNPV ORF 75基因位于病毒基因組70 485 bp和71 264 bp之間,編碼259箇氨基痠殘基的多肽,預測分子相對質量為30.8 kDa,等電點為7.67,分子式為C1409H2157N351O390S19;蛋白在大腸桿菌內的半衰期大于10 h;痠性氨基痠(Asp + Glu)佔10.5%,堿性氨基痠(Arg + Lys)佔10.8%;蛋白的不穩定指數為42.67,是不穩定蛋白.利用Prosite數據庫掃描,查到4類9箇蛋白脩飾位點.通過Blast搜索氨基痠同源序列髮現,BmNPV ORF 75同源蛋白存在于所有測序的鱗翅目昆蟲桿狀病毒中,不存在于其他非鱗翅目昆蟲桿狀病毒中.同源序列比對結果,BmNPV ORF 75蛋白的氨基痠序列與苜蓿銀紋夜蛾覈型多角體病毒(Autographa californica MNPV) ORF 92之間的同源性達到100%,應為相同基因.依照BmNPV ORF 75同源基因序列相似性,對13種昆蟲桿狀病毒進行進化樹構建分析,其中,BmNPV ORF 75與薄荷灰夜蛾多粒包埋型覈型多角體病毒(Rachiplusia ou MNPV) ORF 89基因進化距離很近,同源性較高.
통과대가잠핵형다각체병독(Bombyx mori,nucleopolyhedrovirus: BmNPV)ORF 75기인핵감산서렬진행생물신식학분석,BmNPV ORF 75기인위우병독기인조70 485 bp화71 264 bp지간,편마259개안기산잔기적다태,예측분자상대질량위30.8 kDa,등전점위7.67,분자식위C1409H2157N351O390S19;단백재대장간균내적반쇠기대우10 h;산성안기산(Asp + Glu)점10.5%,감성안기산(Arg + Lys)점10.8%;단백적불은정지수위42.67,시불은정단백.이용Prosite수거고소묘,사도4류9개단백수식위점.통과Blast수색안기산동원서렬발현,BmNPV ORF 75동원단백존재우소유측서적린시목곤충간상병독중,불존재우기타비린시목곤충간상병독중.동원서렬비대결과,BmNPV ORF 75단백적안기산서렬여목숙은문야아핵형다각체병독(Autographa californica MNPV) ORF 92지간적동원성체도100%,응위상동기인.의조BmNPV ORF 75동원기인서렬상사성,대13충곤충간상병독진행진화수구건분석,기중,BmNPV ORF 75여박하회야아다립포매형핵형다각체병독(Rachiplusia ou MNPV) ORF 89기인진화거리흔근,동원성교고.