水生态学杂志
水生態學雜誌
수생태학잡지
JOURNAL OF HYDROECOLOGY
2008年
5期
75-79
,共5页
拟态弧菌%OmpU%抗原表位%多表位疫苗%分子设计
擬態弧菌%OmpU%抗原錶位%多錶位疫苗%分子設計
의태호균%OmpU%항원표위%다표위역묘%분자설계
以拟态弧菌安徽分离株OmpU基因序列为基础,应用DNAStar Protean软件联合采用多种方法对OmpU的二级结构、柔性、亲水性、表面可能性和抗原指数等方面进行分析,预测OmpU的抗原表位,并以此设计多表位疫苗分子序列.结果表明,拟态弧菌OmpU至少含有9个B细胞表位,其中第24～31、56～66、93～111、123～129、183～198、253～258和275～287共7个区段的平均抗原指数较高.使用AAY接头以epitope5-epitope7-epitope2-epitope6-epitope3-epitope4-epitopel排列方式串联的多表位序列最接近原蛋白构象,各表位间相对独立,抗原性参数也较好,可作为研制多表位疫苗的候选分子序列.
以擬態弧菌安徽分離株OmpU基因序列為基礎,應用DNAStar Protean軟件聯閤採用多種方法對OmpU的二級結構、柔性、親水性、錶麵可能性和抗原指數等方麵進行分析,預測OmpU的抗原錶位,併以此設計多錶位疫苗分子序列.結果錶明,擬態弧菌OmpU至少含有9箇B細胞錶位,其中第24～31、56～66、93～111、123～129、183～198、253～258和275～287共7箇區段的平均抗原指數較高.使用AAY接頭以epitope5-epitope7-epitope2-epitope6-epitope3-epitope4-epitopel排列方式串聯的多錶位序列最接近原蛋白構象,各錶位間相對獨立,抗原性參數也較好,可作為研製多錶位疫苗的候選分子序列.
이의태호균안휘분리주OmpU기인서렬위기출,응용DNAStar Protean연건연합채용다충방법대OmpU적이급결구、유성、친수성、표면가능성화항원지수등방면진행분석,예측OmpU적항원표위,병이차설계다표위역묘분자서렬.결과표명,의태호균OmpU지소함유9개B세포표위,기중제24～31、56～66、93～111、123～129、183～198、253～258화275～287공7개구단적평균항원지수교고.사용AAY접두이epitope5-epitope7-epitope2-epitope6-epitope3-epitope4-epitopel배렬방식천련적다표위서렬최접근원단백구상,각표위간상대독립,항원성삼수야교호,가작위연제다표위역묘적후선분자서렬.
